Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z180

Setbp1, SET-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setbp1Q9Z180 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Setbp1Q9Z180 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Setbp1Q9Z180 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Setbp1Q9Z180 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
Setbp1Q9Z180 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Setbp1Q9Z180 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Setbp1Q9Z180 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Setbp1Q9Z180 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Setbp1Q9Z180 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Setbp1Q9Z180 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Setbp1Q9Z180 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
Setbp1Q9Z180 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Setbp1Q9Z180 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Setbp1Q9Z180 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
Setbp1Q9Z180 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Setbp1Q9Z180 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Setbp1Q9Z180 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC37.38■■■■□ 3.58
Setbp1Q9Z180 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Setbp1Q9Z180 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Setbp1Q9Z180 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Setbp1Q9Z180 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Setbp1Q9Z180 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Setbp1Q9Z180 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Setbp1Q9Z180 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
Setbp1Q9Z180 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Setbp1Q9Z180 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Setbp1Q9Z180 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Setbp1Q9Z180 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Setbp1Q9Z180 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
Setbp1Q9Z180 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Setbp1Q9Z180 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Setbp1Q9Z180 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Setbp1Q9Z180 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Setbp1Q9Z180 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
Setbp1Q9Z180 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Setbp1Q9Z180 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Setbp1Q9Z180 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
Setbp1Q9Z180 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Setbp1Q9Z180 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Setbp1Q9Z180 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Setbp1Q9Z180 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
Setbp1Q9Z180 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Setbp1Q9Z180 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Setbp1Q9Z180 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Setbp1Q9Z180 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Setbp1Q9Z180 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
Setbp1Q9Z180 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Setbp1Q9Z180 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Setbp1Q9Z180 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Setbp1Q9Z180 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
Setbp1Q9Z180 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Setbp1Q9Z180 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Setbp1Q9Z180 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Setbp1Q9Z180 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Setbp1Q9Z180 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Setbp1Q9Z180 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Setbp1Q9Z180 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Setbp1Q9Z180 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Setbp1Q9Z180 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Setbp1Q9Z180 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Setbp1Q9Z180 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Setbp1Q9Z180 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Setbp1Q9Z180 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Setbp1Q9Z180 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Setbp1Q9Z180 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
Setbp1Q9Z180 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Setbp1Q9Z180 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Setbp1Q9Z180 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Setbp1Q9Z180 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Setbp1Q9Z180 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Setbp1Q9Z180 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Setbp1Q9Z180 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Setbp1Q9Z180 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Setbp1Q9Z180 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Setbp1Q9Z180 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Setbp1Q9Z180 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Setbp1Q9Z180 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Setbp1Q9Z180 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
Setbp1Q9Z180 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Setbp1Q9Z180 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Setbp1Q9Z180 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
Setbp1Q9Z180 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Setbp1Q9Z180 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Setbp1Q9Z180 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Setbp1Q9Z180 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Setbp1Q9Z180 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
Setbp1Q9Z180 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
Setbp1Q9Z180 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Setbp1Q9Z180 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Setbp1Q9Z180 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Setbp1Q9Z180 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Setbp1Q9Z180 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Setbp1Q9Z180 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
Setbp1Q9Z180 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Setbp1Q9Z180 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Setbp1Q9Z180 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Setbp1Q9Z180 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Setbp1Q9Z180 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Setbp1Q9Z180 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Setbp1Q9Z180 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms