Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
Nup160Q9Z0W3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Nup160Q9Z0W3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
Nup160Q9Z0W3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
Nup160Q9Z0W3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC38.85■■■■□ 3.81
Nup160Q9Z0W3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
Nup160Q9Z0W3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Nup160Q9Z0W3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Nup160Q9Z0W3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Nup160Q9Z0W3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Nup160Q9Z0W3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Nup160Q9Z0W3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Nup160Q9Z0W3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Nup160Q9Z0W3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Nup160Q9Z0W3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
Nup160Q9Z0W3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
Nup160Q9Z0W3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Nup160Q9Z0W3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Nup160Q9Z0W3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Nup160Q9Z0W3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Nup160Q9Z0W3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Nup160Q9Z0W3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
Nup160Q9Z0W3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Nup160Q9Z0W3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Nup160Q9Z0W3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Nup160Q9Z0W3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
Nup160Q9Z0W3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Nup160Q9Z0W3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Nup160Q9Z0W3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
Nup160Q9Z0W3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC38.7■■■■□ 3.79
Nup160Q9Z0W3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
Nup160Q9Z0W3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
Nup160Q9Z0W3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC38.69■■■■□ 3.78
Nup160Q9Z0W3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Nup160Q9Z0W3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
Nup160Q9Z0W3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Nup160Q9Z0W3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Nup160Q9Z0W3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Nup160Q9Z0W3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC38.64■■■■□ 3.78
Nup160Q9Z0W3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
Nup160Q9Z0W3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Nup160Q9Z0W3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Nup160Q9Z0W3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Nup160Q9Z0W3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
Nup160Q9Z0W3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Nup160Q9Z0W3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
Nup160Q9Z0W3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.77
Nup160Q9Z0W3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
Nup160Q9Z0W3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Nup160Q9Z0W3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
Nup160Q9Z0W3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Nup160Q9Z0W3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Nup160Q9Z0W3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Nup160Q9Z0W3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Nup160Q9Z0W3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
Nup160Q9Z0W3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
Nup160Q9Z0W3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Nup160Q9Z0W3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Nup160Q9Z0W3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Nup160Q9Z0W3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Nup160Q9Z0W3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Nup160Q9Z0W3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Nup160Q9Z0W3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Nup160Q9Z0W3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Nup160Q9Z0W3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Nup160Q9Z0W3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Nup160Q9Z0W3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
Nup160Q9Z0W3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
Nup160Q9Z0W3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
Nup160Q9Z0W3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
Nup160Q9Z0W3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Nup160Q9Z0W3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Nup160Q9Z0W3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Nup160Q9Z0W3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Nup160Q9Z0W3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
Nup160Q9Z0W3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
Nup160Q9Z0W3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Nup160Q9Z0W3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Nup160Q9Z0W3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Nup160Q9Z0W3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Nup160Q9Z0W3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Nup160Q9Z0W3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
Nup160Q9Z0W3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Nup160Q9Z0W3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Nup160Q9Z0W3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Nup160Q9Z0W3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
Nup160Q9Z0W3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Nup160Q9Z0W3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Nup160Q9Z0W3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Nup160Q9Z0W3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Nup160Q9Z0W3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Nup160Q9Z0W3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Nup160Q9Z0W3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Nup160Q9Z0W3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Nup160Q9Z0W3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Nup160Q9Z0W3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Nup160Q9Z0W3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC38.32■■■■□ 3.73
Nup160Q9Z0W3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.73
Nup160Q9Z0W3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Nup160Q9Z0W3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms