Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PapolbQ9WVP6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PapolbQ9WVP6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PapolbQ9WVP6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PapolbQ9WVP6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PapolbQ9WVP6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PapolbQ9WVP6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PapolbQ9WVP6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PapolbQ9WVP6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PapolbQ9WVP6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PapolbQ9WVP6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PapolbQ9WVP6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PapolbQ9WVP6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PapolbQ9WVP6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PapolbQ9WVP6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PapolbQ9WVP6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PapolbQ9WVP6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PapolbQ9WVP6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PapolbQ9WVP6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PapolbQ9WVP6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PapolbQ9WVP6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PapolbQ9WVP6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PapolbQ9WVP6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PapolbQ9WVP6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PapolbQ9WVP6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PapolbQ9WVP6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PapolbQ9WVP6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PapolbQ9WVP6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PapolbQ9WVP6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PapolbQ9WVP6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PapolbQ9WVP6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PapolbQ9WVP6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PapolbQ9WVP6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PapolbQ9WVP6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PapolbQ9WVP6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PapolbQ9WVP6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PapolbQ9WVP6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PapolbQ9WVP6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PapolbQ9WVP6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PapolbQ9WVP6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PapolbQ9WVP6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PapolbQ9WVP6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PapolbQ9WVP6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PapolbQ9WVP6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PapolbQ9WVP6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PapolbQ9WVP6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PapolbQ9WVP6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PapolbQ9WVP6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PapolbQ9WVP6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PapolbQ9WVP6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PapolbQ9WVP6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PapolbQ9WVP6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PapolbQ9WVP6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PapolbQ9WVP6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PapolbQ9WVP6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PapolbQ9WVP6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PapolbQ9WVP6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PapolbQ9WVP6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PapolbQ9WVP6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PapolbQ9WVP6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PapolbQ9WVP6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PapolbQ9WVP6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PapolbQ9WVP6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PapolbQ9WVP6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PapolbQ9WVP6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PapolbQ9WVP6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PapolbQ9WVP6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PapolbQ9WVP6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PapolbQ9WVP6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PapolbQ9WVP6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PapolbQ9WVP6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PapolbQ9WVP6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PapolbQ9WVP6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PapolbQ9WVP6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PapolbQ9WVP6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PapolbQ9WVP6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PapolbQ9WVP6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PapolbQ9WVP6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PapolbQ9WVP6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PapolbQ9WVP6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PapolbQ9WVP6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PapolbQ9WVP6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PapolbQ9WVP6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PapolbQ9WVP6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PapolbQ9WVP6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PapolbQ9WVP6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PapolbQ9WVP6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PapolbQ9WVP6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PapolbQ9WVP6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PapolbQ9WVP6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PapolbQ9WVP6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PapolbQ9WVP6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PapolbQ9WVP6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PapolbQ9WVP6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PapolbQ9WVP6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PapolbQ9WVP6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PapolbQ9WVP6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PapolbQ9WVP6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PapolbQ9WVP6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PapolbQ9WVP6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms