Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV76

Ap4b1, AP-4 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4b1Q9WV76 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ap4b1Q9WV76 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ap4b1Q9WV76 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ap4b1Q9WV76 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ap4b1Q9WV76 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ap4b1Q9WV76 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ap4b1Q9WV76 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ap4b1Q9WV76 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ap4b1Q9WV76 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ap4b1Q9WV76 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ap4b1Q9WV76 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ap4b1Q9WV76 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ap4b1Q9WV76 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ap4b1Q9WV76 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ap4b1Q9WV76 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ap4b1Q9WV76 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ap4b1Q9WV76 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ap4b1Q9WV76 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ap4b1Q9WV76 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ap4b1Q9WV76 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ap4b1Q9WV76 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ap4b1Q9WV76 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ap4b1Q9WV76 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ap4b1Q9WV76 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ap4b1Q9WV76 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ap4b1Q9WV76 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ap4b1Q9WV76 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ap4b1Q9WV76 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ap4b1Q9WV76 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ap4b1Q9WV76 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ap4b1Q9WV76 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ap4b1Q9WV76 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ap4b1Q9WV76 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ap4b1Q9WV76 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ap4b1Q9WV76 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ap4b1Q9WV76 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ap4b1Q9WV76 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ap4b1Q9WV76 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ap4b1Q9WV76 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ap4b1Q9WV76 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap4b1Q9WV76 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap4b1Q9WV76 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap4b1Q9WV76 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap4b1Q9WV76 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap4b1Q9WV76 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap4b1Q9WV76 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap4b1Q9WV76 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap4b1Q9WV76 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap4b1Q9WV76 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap4b1Q9WV76 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap4b1Q9WV76 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ap4b1Q9WV76 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ap4b1Q9WV76 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ap4b1Q9WV76 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ap4b1Q9WV76 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ap4b1Q9WV76 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ap4b1Q9WV76 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ap4b1Q9WV76 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ap4b1Q9WV76 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ap4b1Q9WV76 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ap4b1Q9WV76 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ap4b1Q9WV76 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ap4b1Q9WV76 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ap4b1Q9WV76 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ap4b1Q9WV76 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ap4b1Q9WV76 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ap4b1Q9WV76 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ap4b1Q9WV76 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ap4b1Q9WV76 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ap4b1Q9WV76 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ap4b1Q9WV76 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ap4b1Q9WV76 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ap4b1Q9WV76 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ap4b1Q9WV76 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ap4b1Q9WV76 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ap4b1Q9WV76 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ap4b1Q9WV76 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ap4b1Q9WV76 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ap4b1Q9WV76 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap4b1Q9WV76 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap4b1Q9WV76 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap4b1Q9WV76 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap4b1Q9WV76 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap4b1Q9WV76 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ap4b1Q9WV76 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ap4b1Q9WV76 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap4b1Q9WV76 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap4b1Q9WV76 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap4b1Q9WV76 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap4b1Q9WV76 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap4b1Q9WV76 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ap4b1Q9WV76 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ap4b1Q9WV76 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ap4b1Q9WV76 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ap4b1Q9WV76 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ap4b1Q9WV76 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ap4b1Q9WV76 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ap4b1Q9WV76 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ap4b1Q9WV76 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ap4b1Q9WV76 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms