Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tnip1Q9WUU8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tnip1Q9WUU8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tnip1Q9WUU8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tnip1Q9WUU8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tnip1Q9WUU8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tnip1Q9WUU8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tnip1Q9WUU8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tnip1Q9WUU8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tnip1Q9WUU8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tnip1Q9WUU8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tnip1Q9WUU8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tnip1Q9WUU8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tnip1Q9WUU8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Tnip1Q9WUU8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tnip1Q9WUU8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tnip1Q9WUU8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tnip1Q9WUU8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tnip1Q9WUU8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tnip1Q9WUU8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Tnip1Q9WUU8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tnip1Q9WUU8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tnip1Q9WUU8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tnip1Q9WUU8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tnip1Q9WUU8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Tnip1Q9WUU8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tnip1Q9WUU8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tnip1Q9WUU8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tnip1Q9WUU8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Tnip1Q9WUU8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tnip1Q9WUU8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tnip1Q9WUU8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tnip1Q9WUU8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tnip1Q9WUU8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tnip1Q9WUU8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tnip1Q9WUU8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tnip1Q9WUU8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tnip1Q9WUU8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tnip1Q9WUU8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tnip1Q9WUU8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tnip1Q9WUU8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tnip1Q9WUU8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tnip1Q9WUU8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tnip1Q9WUU8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tnip1Q9WUU8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Tnip1Q9WUU8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tnip1Q9WUU8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tnip1Q9WUU8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tnip1Q9WUU8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tnip1Q9WUU8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tnip1Q9WUU8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Tnip1Q9WUU8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Tnip1Q9WUU8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tnip1Q9WUU8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tnip1Q9WUU8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Tnip1Q9WUU8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tnip1Q9WUU8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tnip1Q9WUU8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Tnip1Q9WUU8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tnip1Q9WUU8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tnip1Q9WUU8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tnip1Q9WUU8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Tnip1Q9WUU8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tnip1Q9WUU8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tnip1Q9WUU8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Tnip1Q9WUU8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tnip1Q9WUU8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tnip1Q9WUU8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tnip1Q9WUU8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tnip1Q9WUU8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tnip1Q9WUU8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tnip1Q9WUU8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tnip1Q9WUU8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tnip1Q9WUU8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tnip1Q9WUU8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Tnip1Q9WUU8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tnip1Q9WUU8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tnip1Q9WUU8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tnip1Q9WUU8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tnip1Q9WUU8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tnip1Q9WUU8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tnip1Q9WUU8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tnip1Q9WUU8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Tnip1Q9WUU8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tnip1Q9WUU8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tnip1Q9WUU8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tnip1Q9WUU8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Tnip1Q9WUU8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tnip1Q9WUU8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tnip1Q9WUU8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tnip1Q9WUU8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Tnip1Q9WUU8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tnip1Q9WUU8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tnip1Q9WUU8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tnip1Q9WUU8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Tnip1Q9WUU8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tnip1Q9WUU8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tnip1Q9WUU8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tnip1Q9WUU8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tnip1Q9WUU8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms