Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUN8

Lbx2, Transcription factor LBX2, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx2Q9WUN8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lbx2Q9WUN8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lbx2Q9WUN8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lbx2Q9WUN8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lbx2Q9WUN8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lbx2Q9WUN8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lbx2Q9WUN8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lbx2Q9WUN8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lbx2Q9WUN8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lbx2Q9WUN8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lbx2Q9WUN8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lbx2Q9WUN8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lbx2Q9WUN8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lbx2Q9WUN8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lbx2Q9WUN8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lbx2Q9WUN8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lbx2Q9WUN8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lbx2Q9WUN8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lbx2Q9WUN8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lbx2Q9WUN8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lbx2Q9WUN8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lbx2Q9WUN8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lbx2Q9WUN8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Lbx2Q9WUN8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lbx2Q9WUN8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lbx2Q9WUN8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lbx2Q9WUN8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lbx2Q9WUN8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lbx2Q9WUN8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lbx2Q9WUN8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lbx2Q9WUN8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lbx2Q9WUN8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lbx2Q9WUN8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lbx2Q9WUN8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lbx2Q9WUN8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lbx2Q9WUN8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lbx2Q9WUN8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lbx2Q9WUN8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lbx2Q9WUN8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lbx2Q9WUN8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lbx2Q9WUN8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lbx2Q9WUN8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lbx2Q9WUN8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lbx2Q9WUN8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lbx2Q9WUN8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lbx2Q9WUN8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lbx2Q9WUN8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lbx2Q9WUN8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lbx2Q9WUN8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lbx2Q9WUN8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lbx2Q9WUN8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lbx2Q9WUN8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lbx2Q9WUN8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Lbx2Q9WUN8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lbx2Q9WUN8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lbx2Q9WUN8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lbx2Q9WUN8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lbx2Q9WUN8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lbx2Q9WUN8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lbx2Q9WUN8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lbx2Q9WUN8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lbx2Q9WUN8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lbx2Q9WUN8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lbx2Q9WUN8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lbx2Q9WUN8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lbx2Q9WUN8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lbx2Q9WUN8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lbx2Q9WUN8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lbx2Q9WUN8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lbx2Q9WUN8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lbx2Q9WUN8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lbx2Q9WUN8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lbx2Q9WUN8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lbx2Q9WUN8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lbx2Q9WUN8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lbx2Q9WUN8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lbx2Q9WUN8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lbx2Q9WUN8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lbx2Q9WUN8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lbx2Q9WUN8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lbx2Q9WUN8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lbx2Q9WUN8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lbx2Q9WUN8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lbx2Q9WUN8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lbx2Q9WUN8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lbx2Q9WUN8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lbx2Q9WUN8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lbx2Q9WUN8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lbx2Q9WUN8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lbx2Q9WUN8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lbx2Q9WUN8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lbx2Q9WUN8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lbx2Q9WUN8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lbx2Q9WUN8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lbx2Q9WUN8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lbx2Q9WUN8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lbx2Q9WUN8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lbx2Q9WUN8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lbx2Q9WUN8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lbx2Q9WUN8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms