Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTW4

Tfec, Transcription factor EC, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfecQ9WTW4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TfecQ9WTW4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TfecQ9WTW4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TfecQ9WTW4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TfecQ9WTW4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TfecQ9WTW4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TfecQ9WTW4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TfecQ9WTW4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TfecQ9WTW4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TfecQ9WTW4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TfecQ9WTW4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TfecQ9WTW4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TfecQ9WTW4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TfecQ9WTW4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TfecQ9WTW4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TfecQ9WTW4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TfecQ9WTW4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TfecQ9WTW4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TfecQ9WTW4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TfecQ9WTW4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TfecQ9WTW4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TfecQ9WTW4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TfecQ9WTW4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TfecQ9WTW4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TfecQ9WTW4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TfecQ9WTW4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TfecQ9WTW4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TfecQ9WTW4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TfecQ9WTW4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TfecQ9WTW4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TfecQ9WTW4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TfecQ9WTW4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TfecQ9WTW4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TfecQ9WTW4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TfecQ9WTW4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TfecQ9WTW4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TfecQ9WTW4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TfecQ9WTW4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TfecQ9WTW4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TfecQ9WTW4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TfecQ9WTW4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TfecQ9WTW4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TfecQ9WTW4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TfecQ9WTW4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TfecQ9WTW4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TfecQ9WTW4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TfecQ9WTW4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TfecQ9WTW4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TfecQ9WTW4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TfecQ9WTW4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TfecQ9WTW4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TfecQ9WTW4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TfecQ9WTW4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TfecQ9WTW4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TfecQ9WTW4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TfecQ9WTW4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TfecQ9WTW4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TfecQ9WTW4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TfecQ9WTW4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TfecQ9WTW4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TfecQ9WTW4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TfecQ9WTW4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TfecQ9WTW4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TfecQ9WTW4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TfecQ9WTW4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TfecQ9WTW4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TfecQ9WTW4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TfecQ9WTW4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TfecQ9WTW4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TfecQ9WTW4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TfecQ9WTW4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TfecQ9WTW4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TfecQ9WTW4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TfecQ9WTW4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TfecQ9WTW4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TfecQ9WTW4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TfecQ9WTW4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TfecQ9WTW4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TfecQ9WTW4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TfecQ9WTW4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TfecQ9WTW4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TfecQ9WTW4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TfecQ9WTW4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TfecQ9WTW4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TfecQ9WTW4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TfecQ9WTW4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TfecQ9WTW4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TfecQ9WTW4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TfecQ9WTW4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TfecQ9WTW4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TfecQ9WTW4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TfecQ9WTW4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TfecQ9WTW4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TfecQ9WTW4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TfecQ9WTW4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TfecQ9WTW4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TfecQ9WTW4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TfecQ9WTW4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TfecQ9WTW4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TfecQ9WTW4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms