Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema6cQ9WTM3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema6cQ9WTM3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema6cQ9WTM3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema6cQ9WTM3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema6cQ9WTM3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema6cQ9WTM3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema6cQ9WTM3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema6cQ9WTM3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema6cQ9WTM3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema6cQ9WTM3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sema6cQ9WTM3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema6cQ9WTM3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema6cQ9WTM3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema6cQ9WTM3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema6cQ9WTM3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema6cQ9WTM3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema6cQ9WTM3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema6cQ9WTM3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sema6cQ9WTM3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema6cQ9WTM3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema6cQ9WTM3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema6cQ9WTM3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema6cQ9WTM3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema6cQ9WTM3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sema6cQ9WTM3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema6cQ9WTM3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema6cQ9WTM3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema6cQ9WTM3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema6cQ9WTM3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema6cQ9WTM3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sema6cQ9WTM3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema6cQ9WTM3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema6cQ9WTM3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema6cQ9WTM3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema6cQ9WTM3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema6cQ9WTM3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema6cQ9WTM3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema6cQ9WTM3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema6cQ9WTM3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema6cQ9WTM3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sema6cQ9WTM3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema6cQ9WTM3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema6cQ9WTM3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema6cQ9WTM3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sema6cQ9WTM3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema6cQ9WTM3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema6cQ9WTM3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema6cQ9WTM3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema6cQ9WTM3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema6cQ9WTM3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema6cQ9WTM3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema6cQ9WTM3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema6cQ9WTM3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema6cQ9WTM3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema6cQ9WTM3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema6cQ9WTM3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema6cQ9WTM3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema6cQ9WTM3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema6cQ9WTM3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema6cQ9WTM3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema6cQ9WTM3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sema6cQ9WTM3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sema6cQ9WTM3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema6cQ9WTM3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema6cQ9WTM3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema6cQ9WTM3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema6cQ9WTM3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema6cQ9WTM3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema6cQ9WTM3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema6cQ9WTM3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema6cQ9WTM3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema6cQ9WTM3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema6cQ9WTM3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema6cQ9WTM3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sema6cQ9WTM3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema6cQ9WTM3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sema6cQ9WTM3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema6cQ9WTM3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sema6cQ9WTM3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema6cQ9WTM3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema6cQ9WTM3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sema6cQ9WTM3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sema6cQ9WTM3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema6cQ9WTM3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema6cQ9WTM3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema6cQ9WTM3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema6cQ9WTM3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema6cQ9WTM3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema6cQ9WTM3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema6cQ9WTM3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema6cQ9WTM3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema6cQ9WTM3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema6cQ9WTM3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema6cQ9WTM3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema6cQ9WTM3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema6cQ9WTM3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema6cQ9WTM3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema6cQ9WTM3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema6cQ9WTM3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms