Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTK8

Spo11, Meiotic recombination protein SPO11, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spo11Q9WTK8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spo11Q9WTK8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spo11Q9WTK8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spo11Q9WTK8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spo11Q9WTK8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Spo11Q9WTK8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spo11Q9WTK8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spo11Q9WTK8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spo11Q9WTK8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spo11Q9WTK8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spo11Q9WTK8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spo11Q9WTK8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spo11Q9WTK8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spo11Q9WTK8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spo11Q9WTK8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spo11Q9WTK8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spo11Q9WTK8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spo11Q9WTK8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spo11Q9WTK8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spo11Q9WTK8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spo11Q9WTK8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spo11Q9WTK8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spo11Q9WTK8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spo11Q9WTK8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spo11Q9WTK8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Spo11Q9WTK8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Spo11Q9WTK8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spo11Q9WTK8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Spo11Q9WTK8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spo11Q9WTK8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spo11Q9WTK8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spo11Q9WTK8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spo11Q9WTK8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spo11Q9WTK8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spo11Q9WTK8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spo11Q9WTK8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spo11Q9WTK8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spo11Q9WTK8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spo11Q9WTK8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spo11Q9WTK8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spo11Q9WTK8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spo11Q9WTK8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spo11Q9WTK8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spo11Q9WTK8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spo11Q9WTK8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spo11Q9WTK8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spo11Q9WTK8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spo11Q9WTK8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spo11Q9WTK8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spo11Q9WTK8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spo11Q9WTK8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spo11Q9WTK8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Spo11Q9WTK8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Spo11Q9WTK8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spo11Q9WTK8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spo11Q9WTK8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spo11Q9WTK8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spo11Q9WTK8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spo11Q9WTK8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spo11Q9WTK8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spo11Q9WTK8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spo11Q9WTK8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spo11Q9WTK8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spo11Q9WTK8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spo11Q9WTK8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spo11Q9WTK8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spo11Q9WTK8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spo11Q9WTK8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spo11Q9WTK8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spo11Q9WTK8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spo11Q9WTK8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spo11Q9WTK8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spo11Q9WTK8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spo11Q9WTK8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spo11Q9WTK8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spo11Q9WTK8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spo11Q9WTK8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spo11Q9WTK8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spo11Q9WTK8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Spo11Q9WTK8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spo11Q9WTK8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Spo11Q9WTK8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spo11Q9WTK8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spo11Q9WTK8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Spo11Q9WTK8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spo11Q9WTK8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spo11Q9WTK8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spo11Q9WTK8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spo11Q9WTK8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spo11Q9WTK8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spo11Q9WTK8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spo11Q9WTK8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spo11Q9WTK8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spo11Q9WTK8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spo11Q9WTK8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spo11Q9WTK8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Spo11Q9WTK8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spo11Q9WTK8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spo11Q9WTK8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spo11Q9WTK8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms