Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Fam50bQ9WTJ8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Fam50bQ9WTJ8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Fam50bQ9WTJ8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Fam50bQ9WTJ8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Fam50bQ9WTJ8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Fam50bQ9WTJ8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Fam50bQ9WTJ8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Fam50bQ9WTJ8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Fam50bQ9WTJ8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Fam50bQ9WTJ8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Fam50bQ9WTJ8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Fam50bQ9WTJ8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Fam50bQ9WTJ8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Fam50bQ9WTJ8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Fam50bQ9WTJ8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Fam50bQ9WTJ8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Fam50bQ9WTJ8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Fam50bQ9WTJ8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Fam50bQ9WTJ8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Fam50bQ9WTJ8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Fam50bQ9WTJ8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
Fam50bQ9WTJ8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Fam50bQ9WTJ8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Fam50bQ9WTJ8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Fam50bQ9WTJ8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Fam50bQ9WTJ8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Fam50bQ9WTJ8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Fam50bQ9WTJ8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Fam50bQ9WTJ8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Fam50bQ9WTJ8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Fam50bQ9WTJ8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Fam50bQ9WTJ8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Fam50bQ9WTJ8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Fam50bQ9WTJ8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Fam50bQ9WTJ8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Fam50bQ9WTJ8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Fam50bQ9WTJ8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Fam50bQ9WTJ8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Fam50bQ9WTJ8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Fam50bQ9WTJ8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Fam50bQ9WTJ8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Fam50bQ9WTJ8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Fam50bQ9WTJ8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Fam50bQ9WTJ8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Fam50bQ9WTJ8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Fam50bQ9WTJ8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Fam50bQ9WTJ8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Fam50bQ9WTJ8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Fam50bQ9WTJ8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Fam50bQ9WTJ8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Fam50bQ9WTJ8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Fam50bQ9WTJ8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Fam50bQ9WTJ8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Fam50bQ9WTJ8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Fam50bQ9WTJ8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Fam50bQ9WTJ8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Fam50bQ9WTJ8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Fam50bQ9WTJ8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Fam50bQ9WTJ8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Fam50bQ9WTJ8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Fam50bQ9WTJ8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Fam50bQ9WTJ8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Fam50bQ9WTJ8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Fam50bQ9WTJ8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Fam50bQ9WTJ8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Fam50bQ9WTJ8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Fam50bQ9WTJ8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Fam50bQ9WTJ8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Fam50bQ9WTJ8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Fam50bQ9WTJ8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Fam50bQ9WTJ8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Fam50bQ9WTJ8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Fam50bQ9WTJ8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Fam50bQ9WTJ8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Fam50bQ9WTJ8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Fam50bQ9WTJ8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Fam50bQ9WTJ8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Fam50bQ9WTJ8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Fam50bQ9WTJ8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Fam50bQ9WTJ8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Fam50bQ9WTJ8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Fam50bQ9WTJ8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Fam50bQ9WTJ8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Fam50bQ9WTJ8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Fam50bQ9WTJ8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Fam50bQ9WTJ8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Fam50bQ9WTJ8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Fam50bQ9WTJ8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Fam50bQ9WTJ8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Fam50bQ9WTJ8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
Fam50bQ9WTJ8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Fam50bQ9WTJ8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Fam50bQ9WTJ8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Fam50bQ9WTJ8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Fam50bQ9WTJ8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Fam50bQ9WTJ8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Fam50bQ9WTJ8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Fam50bQ9WTJ8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Fam50bQ9WTJ8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms