Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L1

Hsf4, Heat shock factor protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsf4Q9R0L1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hsf4Q9R0L1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hsf4Q9R0L1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Hsf4Q9R0L1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Hsf4Q9R0L1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hsf4Q9R0L1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Hsf4Q9R0L1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hsf4Q9R0L1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Hsf4Q9R0L1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hsf4Q9R0L1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hsf4Q9R0L1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hsf4Q9R0L1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hsf4Q9R0L1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hsf4Q9R0L1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hsf4Q9R0L1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hsf4Q9R0L1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hsf4Q9R0L1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hsf4Q9R0L1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hsf4Q9R0L1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hsf4Q9R0L1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hsf4Q9R0L1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hsf4Q9R0L1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hsf4Q9R0L1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hsf4Q9R0L1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hsf4Q9R0L1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hsf4Q9R0L1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hsf4Q9R0L1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hsf4Q9R0L1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hsf4Q9R0L1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hsf4Q9R0L1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hsf4Q9R0L1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hsf4Q9R0L1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hsf4Q9R0L1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hsf4Q9R0L1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hsf4Q9R0L1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hsf4Q9R0L1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hsf4Q9R0L1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hsf4Q9R0L1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hsf4Q9R0L1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hsf4Q9R0L1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Hsf4Q9R0L1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hsf4Q9R0L1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hsf4Q9R0L1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hsf4Q9R0L1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hsf4Q9R0L1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hsf4Q9R0L1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hsf4Q9R0L1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hsf4Q9R0L1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hsf4Q9R0L1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hsf4Q9R0L1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hsf4Q9R0L1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hsf4Q9R0L1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hsf4Q9R0L1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hsf4Q9R0L1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hsf4Q9R0L1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hsf4Q9R0L1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hsf4Q9R0L1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hsf4Q9R0L1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hsf4Q9R0L1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hsf4Q9R0L1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hsf4Q9R0L1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hsf4Q9R0L1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hsf4Q9R0L1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hsf4Q9R0L1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hsf4Q9R0L1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hsf4Q9R0L1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hsf4Q9R0L1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hsf4Q9R0L1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hsf4Q9R0L1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hsf4Q9R0L1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hsf4Q9R0L1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hsf4Q9R0L1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hsf4Q9R0L1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hsf4Q9R0L1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hsf4Q9R0L1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hsf4Q9R0L1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hsf4Q9R0L1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hsf4Q9R0L1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hsf4Q9R0L1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hsf4Q9R0L1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hsf4Q9R0L1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Hsf4Q9R0L1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hsf4Q9R0L1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hsf4Q9R0L1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hsf4Q9R0L1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hsf4Q9R0L1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hsf4Q9R0L1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hsf4Q9R0L1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hsf4Q9R0L1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hsf4Q9R0L1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hsf4Q9R0L1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hsf4Q9R0L1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hsf4Q9R0L1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hsf4Q9R0L1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hsf4Q9R0L1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hsf4Q9R0L1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hsf4Q9R0L1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hsf4Q9R0L1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hsf4Q9R0L1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hsf4Q9R0L1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms