Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC39■■■■□ 3.83
NrkQ9R0G8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC39■■■■□ 3.83
NrkQ9R0G8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
NrkQ9R0G8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
NrkQ9R0G8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
NrkQ9R0G8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
NrkQ9R0G8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
NrkQ9R0G8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
NrkQ9R0G8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
NrkQ9R0G8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
NrkQ9R0G8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
NrkQ9R0G8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
NrkQ9R0G8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
NrkQ9R0G8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
NrkQ9R0G8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
NrkQ9R0G8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
NrkQ9R0G8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
NrkQ9R0G8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
NrkQ9R0G8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
NrkQ9R0G8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
NrkQ9R0G8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
NrkQ9R0G8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
NrkQ9R0G8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
NrkQ9R0G8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
NrkQ9R0G8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
NrkQ9R0G8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
NrkQ9R0G8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
NrkQ9R0G8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
NrkQ9R0G8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC38.9■■■■□ 3.82
NrkQ9R0G8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC38.9■■■■□ 3.82
NrkQ9R0G8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
NrkQ9R0G8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
NrkQ9R0G8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
NrkQ9R0G8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
NrkQ9R0G8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
NrkQ9R0G8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
NrkQ9R0G8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
NrkQ9R0G8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
NrkQ9R0G8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
NrkQ9R0G8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
NrkQ9R0G8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
NrkQ9R0G8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
NrkQ9R0G8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
NrkQ9R0G8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
NrkQ9R0G8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
NrkQ9R0G8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
NrkQ9R0G8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
NrkQ9R0G8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
NrkQ9R0G8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
NrkQ9R0G8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
NrkQ9R0G8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
NrkQ9R0G8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
NrkQ9R0G8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
NrkQ9R0G8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
NrkQ9R0G8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
NrkQ9R0G8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
NrkQ9R0G8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
NrkQ9R0G8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
NrkQ9R0G8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
NrkQ9R0G8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
NrkQ9R0G8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
NrkQ9R0G8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
NrkQ9R0G8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
NrkQ9R0G8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
NrkQ9R0G8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
NrkQ9R0G8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC38.64■■■■□ 3.78
NrkQ9R0G8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC38.64■■■■□ 3.78
NrkQ9R0G8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC38.64■■■■□ 3.78
NrkQ9R0G8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
NrkQ9R0G8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
NrkQ9R0G8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
NrkQ9R0G8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
NrkQ9R0G8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
NrkQ9R0G8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
NrkQ9R0G8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC38.6■■■■□ 3.77
NrkQ9R0G8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
NrkQ9R0G8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
NrkQ9R0G8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
NrkQ9R0G8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
NrkQ9R0G8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
NrkQ9R0G8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
NrkQ9R0G8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
NrkQ9R0G8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
NrkQ9R0G8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
NrkQ9R0G8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
NrkQ9R0G8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
NrkQ9R0G8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
NrkQ9R0G8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
NrkQ9R0G8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
NrkQ9R0G8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
NrkQ9R0G8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
NrkQ9R0G8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
NrkQ9R0G8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
NrkQ9R0G8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
NrkQ9R0G8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
NrkQ9R0G8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
NrkQ9R0G8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
NrkQ9R0G8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
NrkQ9R0G8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
NrkQ9R0G8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms