Protein–RNA interactions for Protein: Q9R069

Bcam, Basal cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcamQ9R069 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BcamQ9R069 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BcamQ9R069 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BcamQ9R069 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
BcamQ9R069 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
BcamQ9R069 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BcamQ9R069 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BcamQ9R069 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BcamQ9R069 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BcamQ9R069 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BcamQ9R069 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BcamQ9R069 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
BcamQ9R069 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BcamQ9R069 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BcamQ9R069 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BcamQ9R069 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BcamQ9R069 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BcamQ9R069 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BcamQ9R069 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BcamQ9R069 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BcamQ9R069 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
BcamQ9R069 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BcamQ9R069 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BcamQ9R069 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BcamQ9R069 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BcamQ9R069 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
BcamQ9R069 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BcamQ9R069 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BcamQ9R069 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BcamQ9R069 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BcamQ9R069 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BcamQ9R069 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BcamQ9R069 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BcamQ9R069 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BcamQ9R069 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BcamQ9R069 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BcamQ9R069 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BcamQ9R069 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BcamQ9R069 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BcamQ9R069 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BcamQ9R069 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BcamQ9R069 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BcamQ9R069 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BcamQ9R069 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BcamQ9R069 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BcamQ9R069 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BcamQ9R069 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BcamQ9R069 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BcamQ9R069 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BcamQ9R069 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BcamQ9R069 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BcamQ9R069 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BcamQ9R069 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BcamQ9R069 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
BcamQ9R069 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BcamQ9R069 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BcamQ9R069 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BcamQ9R069 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BcamQ9R069 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BcamQ9R069 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BcamQ9R069 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
BcamQ9R069 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BcamQ9R069 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BcamQ9R069 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BcamQ9R069 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BcamQ9R069 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BcamQ9R069 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BcamQ9R069 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BcamQ9R069 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BcamQ9R069 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BcamQ9R069 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BcamQ9R069 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BcamQ9R069 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BcamQ9R069 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BcamQ9R069 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BcamQ9R069 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BcamQ9R069 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BcamQ9R069 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BcamQ9R069 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BcamQ9R069 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BcamQ9R069 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BcamQ9R069 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BcamQ9R069 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
BcamQ9R069 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
BcamQ9R069 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BcamQ9R069 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BcamQ9R069 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BcamQ9R069 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BcamQ9R069 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
BcamQ9R069 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BcamQ9R069 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BcamQ9R069 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BcamQ9R069 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BcamQ9R069 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BcamQ9R069 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BcamQ9R069 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BcamQ9R069 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BcamQ9R069 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BcamQ9R069 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BcamQ9R069 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.7 ms