Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
AmfrQ9R049 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
AmfrQ9R049 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
AmfrQ9R049 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
AmfrQ9R049 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AmfrQ9R049 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AmfrQ9R049 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AmfrQ9R049 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
AmfrQ9R049 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
AmfrQ9R049 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
AmfrQ9R049 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AmfrQ9R049 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AmfrQ9R049 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
AmfrQ9R049 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AmfrQ9R049 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AmfrQ9R049 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AmfrQ9R049 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AmfrQ9R049 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
AmfrQ9R049 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AmfrQ9R049 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AmfrQ9R049 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AmfrQ9R049 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
AmfrQ9R049 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AmfrQ9R049 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AmfrQ9R049 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AmfrQ9R049 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AmfrQ9R049 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AmfrQ9R049 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
AmfrQ9R049 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
AmfrQ9R049 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AmfrQ9R049 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
AmfrQ9R049 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AmfrQ9R049 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AmfrQ9R049 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AmfrQ9R049 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AmfrQ9R049 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AmfrQ9R049 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AmfrQ9R049 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AmfrQ9R049 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AmfrQ9R049 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AmfrQ9R049 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AmfrQ9R049 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AmfrQ9R049 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AmfrQ9R049 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AmfrQ9R049 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AmfrQ9R049 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AmfrQ9R049 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AmfrQ9R049 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AmfrQ9R049 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AmfrQ9R049 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
AmfrQ9R049 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
AmfrQ9R049 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AmfrQ9R049 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
AmfrQ9R049 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AmfrQ9R049 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AmfrQ9R049 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AmfrQ9R049 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AmfrQ9R049 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AmfrQ9R049 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AmfrQ9R049 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AmfrQ9R049 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AmfrQ9R049 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AmfrQ9R049 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AmfrQ9R049 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AmfrQ9R049 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AmfrQ9R049 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
AmfrQ9R049 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AmfrQ9R049 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AmfrQ9R049 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AmfrQ9R049 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AmfrQ9R049 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
AmfrQ9R049 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AmfrQ9R049 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AmfrQ9R049 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AmfrQ9R049 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AmfrQ9R049 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AmfrQ9R049 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AmfrQ9R049 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AmfrQ9R049 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AmfrQ9R049 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AmfrQ9R049 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AmfrQ9R049 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AmfrQ9R049 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AmfrQ9R049 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AmfrQ9R049 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AmfrQ9R049 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AmfrQ9R049 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AmfrQ9R049 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AmfrQ9R049 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AmfrQ9R049 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AmfrQ9R049 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AmfrQ9R049 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AmfrQ9R049 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
AmfrQ9R049 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AmfrQ9R049 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AmfrQ9R049 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AmfrQ9R049 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AmfrQ9R049 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AmfrQ9R049 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AmfrQ9R049 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms