Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ8

H2afy, Core histone macro-H2A.1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afyQ9QZQ8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2afyQ9QZQ8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2afyQ9QZQ8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2afyQ9QZQ8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2afyQ9QZQ8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2afyQ9QZQ8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2afyQ9QZQ8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2afyQ9QZQ8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2afyQ9QZQ8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2afyQ9QZQ8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2afyQ9QZQ8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2afyQ9QZQ8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2afyQ9QZQ8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2afyQ9QZQ8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2afyQ9QZQ8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
H2afyQ9QZQ8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2afyQ9QZQ8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2afyQ9QZQ8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2afyQ9QZQ8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2afyQ9QZQ8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2afyQ9QZQ8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2afyQ9QZQ8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2afyQ9QZQ8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2afyQ9QZQ8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2afyQ9QZQ8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2afyQ9QZQ8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2afyQ9QZQ8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2afyQ9QZQ8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2afyQ9QZQ8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2afyQ9QZQ8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2afyQ9QZQ8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2afyQ9QZQ8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2afyQ9QZQ8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2afyQ9QZQ8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2afyQ9QZQ8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2afyQ9QZQ8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2afyQ9QZQ8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2afyQ9QZQ8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2afyQ9QZQ8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2afyQ9QZQ8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2afyQ9QZQ8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2afyQ9QZQ8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2afyQ9QZQ8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2afyQ9QZQ8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2afyQ9QZQ8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2afyQ9QZQ8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2afyQ9QZQ8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2afyQ9QZQ8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2afyQ9QZQ8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2afyQ9QZQ8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2afyQ9QZQ8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2afyQ9QZQ8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2afyQ9QZQ8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2afyQ9QZQ8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2afyQ9QZQ8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2afyQ9QZQ8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2afyQ9QZQ8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2afyQ9QZQ8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2afyQ9QZQ8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2afyQ9QZQ8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2afyQ9QZQ8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2afyQ9QZQ8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H2afyQ9QZQ8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2afyQ9QZQ8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2afyQ9QZQ8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2afyQ9QZQ8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2afyQ9QZQ8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2afyQ9QZQ8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2afyQ9QZQ8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2afyQ9QZQ8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2afyQ9QZQ8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2afyQ9QZQ8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2afyQ9QZQ8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2afyQ9QZQ8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2afyQ9QZQ8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2afyQ9QZQ8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2afyQ9QZQ8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
H2afyQ9QZQ8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
H2afyQ9QZQ8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
H2afyQ9QZQ8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
H2afyQ9QZQ8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
H2afyQ9QZQ8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2afyQ9QZQ8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2afyQ9QZQ8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2afyQ9QZQ8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2afyQ9QZQ8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2afyQ9QZQ8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2afyQ9QZQ8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2afyQ9QZQ8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2afyQ9QZQ8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2afyQ9QZQ8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2afyQ9QZQ8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2afyQ9QZQ8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2afyQ9QZQ8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2afyQ9QZQ8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2afyQ9QZQ8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2afyQ9QZQ8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2afyQ9QZQ8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2afyQ9QZQ8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2afyQ9QZQ8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms