Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tnfrsf10bQ9QZM4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tnfrsf10bQ9QZM4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnfrsf10bQ9QZM4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnfrsf10bQ9QZM4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tnfrsf10bQ9QZM4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tnfrsf10bQ9QZM4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tnfrsf10bQ9QZM4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnfrsf10bQ9QZM4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnfrsf10bQ9QZM4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnfrsf10bQ9QZM4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tnfrsf10bQ9QZM4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tnfrsf10bQ9QZM4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tnfrsf10bQ9QZM4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnfrsf10bQ9QZM4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnfrsf10bQ9QZM4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnfrsf10bQ9QZM4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnfrsf10bQ9QZM4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnfrsf10bQ9QZM4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnfrsf10bQ9QZM4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms