Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYY8

Spast, Spastin, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpastQ9QYY8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SpastQ9QYY8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SpastQ9QYY8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SpastQ9QYY8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SpastQ9QYY8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SpastQ9QYY8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SpastQ9QYY8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SpastQ9QYY8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SpastQ9QYY8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SpastQ9QYY8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SpastQ9QYY8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SpastQ9QYY8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SpastQ9QYY8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SpastQ9QYY8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SpastQ9QYY8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SpastQ9QYY8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SpastQ9QYY8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SpastQ9QYY8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SpastQ9QYY8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SpastQ9QYY8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SpastQ9QYY8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SpastQ9QYY8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SpastQ9QYY8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SpastQ9QYY8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SpastQ9QYY8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SpastQ9QYY8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SpastQ9QYY8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SpastQ9QYY8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SpastQ9QYY8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SpastQ9QYY8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SpastQ9QYY8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SpastQ9QYY8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SpastQ9QYY8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SpastQ9QYY8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SpastQ9QYY8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SpastQ9QYY8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SpastQ9QYY8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SpastQ9QYY8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SpastQ9QYY8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SpastQ9QYY8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SpastQ9QYY8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SpastQ9QYY8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SpastQ9QYY8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SpastQ9QYY8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SpastQ9QYY8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SpastQ9QYY8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SpastQ9QYY8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SpastQ9QYY8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SpastQ9QYY8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SpastQ9QYY8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SpastQ9QYY8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SpastQ9QYY8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SpastQ9QYY8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SpastQ9QYY8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SpastQ9QYY8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SpastQ9QYY8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SpastQ9QYY8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SpastQ9QYY8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SpastQ9QYY8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SpastQ9QYY8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SpastQ9QYY8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SpastQ9QYY8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SpastQ9QYY8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SpastQ9QYY8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SpastQ9QYY8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SpastQ9QYY8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SpastQ9QYY8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SpastQ9QYY8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SpastQ9QYY8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SpastQ9QYY8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SpastQ9QYY8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SpastQ9QYY8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SpastQ9QYY8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SpastQ9QYY8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SpastQ9QYY8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SpastQ9QYY8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SpastQ9QYY8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SpastQ9QYY8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SpastQ9QYY8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SpastQ9QYY8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SpastQ9QYY8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SpastQ9QYY8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SpastQ9QYY8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SpastQ9QYY8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SpastQ9QYY8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SpastQ9QYY8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SpastQ9QYY8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SpastQ9QYY8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SpastQ9QYY8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SpastQ9QYY8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SpastQ9QYY8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SpastQ9QYY8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SpastQ9QYY8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SpastQ9QYY8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SpastQ9QYY8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SpastQ9QYY8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SpastQ9QYY8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SpastQ9QYY8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SpastQ9QYY8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SpastQ9QYY8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms