Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK7

Rnf11, RING finger protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf11Q9QYK7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf11Q9QYK7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf11Q9QYK7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf11Q9QYK7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf11Q9QYK7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf11Q9QYK7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf11Q9QYK7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf11Q9QYK7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf11Q9QYK7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf11Q9QYK7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf11Q9QYK7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf11Q9QYK7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf11Q9QYK7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf11Q9QYK7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf11Q9QYK7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf11Q9QYK7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf11Q9QYK7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf11Q9QYK7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf11Q9QYK7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf11Q9QYK7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf11Q9QYK7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf11Q9QYK7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf11Q9QYK7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf11Q9QYK7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf11Q9QYK7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf11Q9QYK7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf11Q9QYK7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf11Q9QYK7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf11Q9QYK7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf11Q9QYK7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf11Q9QYK7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf11Q9QYK7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf11Q9QYK7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf11Q9QYK7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf11Q9QYK7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf11Q9QYK7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf11Q9QYK7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf11Q9QYK7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf11Q9QYK7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf11Q9QYK7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf11Q9QYK7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf11Q9QYK7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf11Q9QYK7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf11Q9QYK7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf11Q9QYK7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf11Q9QYK7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf11Q9QYK7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf11Q9QYK7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf11Q9QYK7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf11Q9QYK7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf11Q9QYK7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf11Q9QYK7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf11Q9QYK7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf11Q9QYK7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf11Q9QYK7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf11Q9QYK7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf11Q9QYK7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf11Q9QYK7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf11Q9QYK7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf11Q9QYK7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf11Q9QYK7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf11Q9QYK7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf11Q9QYK7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf11Q9QYK7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf11Q9QYK7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf11Q9QYK7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf11Q9QYK7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf11Q9QYK7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf11Q9QYK7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf11Q9QYK7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf11Q9QYK7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf11Q9QYK7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf11Q9QYK7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf11Q9QYK7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf11Q9QYK7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf11Q9QYK7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf11Q9QYK7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf11Q9QYK7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf11Q9QYK7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rnf11Q9QYK7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rnf11Q9QYK7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rnf11Q9QYK7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf11Q9QYK7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf11Q9QYK7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf11Q9QYK7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf11Q9QYK7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf11Q9QYK7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf11Q9QYK7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf11Q9QYK7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf11Q9QYK7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf11Q9QYK7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf11Q9QYK7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf11Q9QYK7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf11Q9QYK7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf11Q9QYK7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf11Q9QYK7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf11Q9QYK7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf11Q9QYK7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf11Q9QYK7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rnf11Q9QYK7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms