Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mid2Q9QUS6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mid2Q9QUS6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Mid2Q9QUS6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mid2Q9QUS6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mid2Q9QUS6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mid2Q9QUS6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Mid2Q9QUS6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mid2Q9QUS6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mid2Q9QUS6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mid2Q9QUS6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mid2Q9QUS6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mid2Q9QUS6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mid2Q9QUS6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mid2Q9QUS6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mid2Q9QUS6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mid2Q9QUS6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mid2Q9QUS6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mid2Q9QUS6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mid2Q9QUS6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mid2Q9QUS6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mid2Q9QUS6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mid2Q9QUS6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mid2Q9QUS6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mid2Q9QUS6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mid2Q9QUS6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mid2Q9QUS6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mid2Q9QUS6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mid2Q9QUS6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mid2Q9QUS6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mid2Q9QUS6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mid2Q9QUS6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mid2Q9QUS6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mid2Q9QUS6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mid2Q9QUS6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mid2Q9QUS6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mid2Q9QUS6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mid2Q9QUS6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mid2Q9QUS6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mid2Q9QUS6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mid2Q9QUS6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mid2Q9QUS6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mid2Q9QUS6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mid2Q9QUS6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mid2Q9QUS6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mid2Q9QUS6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Mid2Q9QUS6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mid2Q9QUS6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mid2Q9QUS6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mid2Q9QUS6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mid2Q9QUS6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mid2Q9QUS6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mid2Q9QUS6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mid2Q9QUS6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mid2Q9QUS6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mid2Q9QUS6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mid2Q9QUS6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mid2Q9QUS6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mid2Q9QUS6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mid2Q9QUS6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mid2Q9QUS6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Mid2Q9QUS6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mid2Q9QUS6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mid2Q9QUS6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mid2Q9QUS6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mid2Q9QUS6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Mid2Q9QUS6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mid2Q9QUS6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mid2Q9QUS6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mid2Q9QUS6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mid2Q9QUS6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mid2Q9QUS6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mid2Q9QUS6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mid2Q9QUS6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mid2Q9QUS6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mid2Q9QUS6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mid2Q9QUS6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mid2Q9QUS6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mid2Q9QUS6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mid2Q9QUS6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mid2Q9QUS6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mid2Q9QUS6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mid2Q9QUS6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mid2Q9QUS6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mid2Q9QUS6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mid2Q9QUS6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mid2Q9QUS6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mid2Q9QUS6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mid2Q9QUS6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mid2Q9QUS6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mid2Q9QUS6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mid2Q9QUS6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mid2Q9QUS6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mid2Q9QUS6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mid2Q9QUS6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mid2Q9QUS6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mid2Q9QUS6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mid2Q9QUS6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mid2Q9QUS6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mid2Q9QUS6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms