Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN5

Prl3c1, Prolactin-3C1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prl3c1Q9QUN5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Prl3c1Q9QUN5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prl3c1Q9QUN5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prl3c1Q9QUN5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prl3c1Q9QUN5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prl3c1Q9QUN5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prl3c1Q9QUN5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prl3c1Q9QUN5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prl3c1Q9QUN5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prl3c1Q9QUN5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Prl3c1Q9QUN5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prl3c1Q9QUN5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prl3c1Q9QUN5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prl3c1Q9QUN5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prl3c1Q9QUN5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prl3c1Q9QUN5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prl3c1Q9QUN5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prl3c1Q9QUN5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prl3c1Q9QUN5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prl3c1Q9QUN5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prl3c1Q9QUN5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prl3c1Q9QUN5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prl3c1Q9QUN5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prl3c1Q9QUN5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prl3c1Q9QUN5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prl3c1Q9QUN5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prl3c1Q9QUN5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prl3c1Q9QUN5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prl3c1Q9QUN5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prl3c1Q9QUN5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Prl3c1Q9QUN5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prl3c1Q9QUN5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prl3c1Q9QUN5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prl3c1Q9QUN5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prl3c1Q9QUN5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prl3c1Q9QUN5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prl3c1Q9QUN5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prl3c1Q9QUN5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prl3c1Q9QUN5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prl3c1Q9QUN5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prl3c1Q9QUN5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Prl3c1Q9QUN5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prl3c1Q9QUN5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prl3c1Q9QUN5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prl3c1Q9QUN5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prl3c1Q9QUN5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prl3c1Q9QUN5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prl3c1Q9QUN5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prl3c1Q9QUN5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prl3c1Q9QUN5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prl3c1Q9QUN5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prl3c1Q9QUN5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prl3c1Q9QUN5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prl3c1Q9QUN5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prl3c1Q9QUN5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prl3c1Q9QUN5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Prl3c1Q9QUN5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Prl3c1Q9QUN5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prl3c1Q9QUN5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prl3c1Q9QUN5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prl3c1Q9QUN5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prl3c1Q9QUN5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prl3c1Q9QUN5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prl3c1Q9QUN5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prl3c1Q9QUN5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prl3c1Q9QUN5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prl3c1Q9QUN5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prl3c1Q9QUN5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prl3c1Q9QUN5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prl3c1Q9QUN5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prl3c1Q9QUN5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prl3c1Q9QUN5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prl3c1Q9QUN5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prl3c1Q9QUN5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prl3c1Q9QUN5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prl3c1Q9QUN5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prl3c1Q9QUN5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prl3c1Q9QUN5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Prl3c1Q9QUN5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prl3c1Q9QUN5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Prl3c1Q9QUN5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prl3c1Q9QUN5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prl3c1Q9QUN5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prl3c1Q9QUN5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prl3c1Q9QUN5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prl3c1Q9QUN5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prl3c1Q9QUN5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prl3c1Q9QUN5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prl3c1Q9QUN5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Prl3c1Q9QUN5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prl3c1Q9QUN5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prl3c1Q9QUN5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prl3c1Q9QUN5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prl3c1Q9QUN5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prl3c1Q9QUN5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prl3c1Q9QUN5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prl3c1Q9QUN5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prl3c1Q9QUN5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prl3c1Q9QUN5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prl3c1Q9QUN5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms