Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Psma6Q9QUM9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psma6Q9QUM9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psma6Q9QUM9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Psma6Q9QUM9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Psma6Q9QUM9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Psma6Q9QUM9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Psma6Q9QUM9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Psma6Q9QUM9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Psma6Q9QUM9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Psma6Q9QUM9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Psma6Q9QUM9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psma6Q9QUM9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Psma6Q9QUM9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Psma6Q9QUM9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psma6Q9QUM9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Psma6Q9QUM9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psma6Q9QUM9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psma6Q9QUM9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psma6Q9QUM9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psma6Q9QUM9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Psma6Q9QUM9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Psma6Q9QUM9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psma6Q9QUM9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psma6Q9QUM9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psma6Q9QUM9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psma6Q9QUM9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psma6Q9QUM9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psma6Q9QUM9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psma6Q9QUM9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psma6Q9QUM9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psma6Q9QUM9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psma6Q9QUM9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psma6Q9QUM9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Psma6Q9QUM9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psma6Q9QUM9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psma6Q9QUM9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psma6Q9QUM9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psma6Q9QUM9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psma6Q9QUM9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psma6Q9QUM9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Psma6Q9QUM9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psma6Q9QUM9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Psma6Q9QUM9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Psma6Q9QUM9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Psma6Q9QUM9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Psma6Q9QUM9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Psma6Q9QUM9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Psma6Q9QUM9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Psma6Q9QUM9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Psma6Q9QUM9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Psma6Q9QUM9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Psma6Q9QUM9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Psma6Q9QUM9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Psma6Q9QUM9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Psma6Q9QUM9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Psma6Q9QUM9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Psma6Q9QUM9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Psma6Q9QUM9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Psma6Q9QUM9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Psma6Q9QUM9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Psma6Q9QUM9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Psma6Q9QUM9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Psma6Q9QUM9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Psma6Q9QUM9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Psma6Q9QUM9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Psma6Q9QUM9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Psma6Q9QUM9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Psma6Q9QUM9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Psma6Q9QUM9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Psma6Q9QUM9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Psma6Q9QUM9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Psma6Q9QUM9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Psma6Q9QUM9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Psma6Q9QUM9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Psma6Q9QUM9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Psma6Q9QUM9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psma6Q9QUM9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psma6Q9QUM9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psma6Q9QUM9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psma6Q9QUM9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psma6Q9QUM9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psma6Q9QUM9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psma6Q9QUM9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psma6Q9QUM9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psma6Q9QUM9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psma6Q9QUM9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psma6Q9QUM9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psma6Q9QUM9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psma6Q9QUM9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psma6Q9QUM9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psma6Q9QUM9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psma6Q9QUM9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psma6Q9QUM9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psma6Q9QUM9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psma6Q9QUM9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psma6Q9QUM9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psma6Q9QUM9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psma6Q9QUM9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psma6Q9QUM9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms