Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Psma6Q9QUM9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Psma6Q9QUM9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Psma6Q9QUM9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Psma6Q9QUM9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Psma6Q9QUM9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Psma6Q9QUM9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Psma6Q9QUM9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Psma6Q9QUM9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Psma6Q9QUM9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Psma6Q9QUM9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Psma6Q9QUM9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Psma6Q9QUM9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Psma6Q9QUM9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Psma6Q9QUM9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Psma6Q9QUM9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Psma6Q9QUM9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Psma6Q9QUM9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Psma6Q9QUM9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Psma6Q9QUM9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Psma6Q9QUM9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Psma6Q9QUM9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Psma6Q9QUM9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Psma6Q9QUM9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Psma6Q9QUM9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Psma6Q9QUM9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Psma6Q9QUM9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Psma6Q9QUM9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Psma6Q9QUM9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Psma6Q9QUM9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Psma6Q9QUM9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Psma6Q9QUM9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Psma6Q9QUM9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Psma6Q9QUM9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Psma6Q9QUM9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Psma6Q9QUM9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Psma6Q9QUM9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Psma6Q9QUM9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Psma6Q9QUM9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Psma6Q9QUM9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Psma6Q9QUM9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Psma6Q9QUM9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Psma6Q9QUM9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Psma6Q9QUM9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Psma6Q9QUM9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Psma6Q9QUM9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Psma6Q9QUM9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Psma6Q9QUM9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Psma6Q9QUM9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Psma6Q9QUM9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Psma6Q9QUM9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Psma6Q9QUM9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Psma6Q9QUM9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Psma6Q9QUM9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psma6Q9QUM9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psma6Q9QUM9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psma6Q9QUM9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Psma6Q9QUM9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Psma6Q9QUM9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psma6Q9QUM9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Psma6Q9QUM9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Psma6Q9QUM9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Psma6Q9QUM9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psma6Q9QUM9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Psma6Q9QUM9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Psma6Q9QUM9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Psma6Q9QUM9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Psma6Q9QUM9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Psma6Q9QUM9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Psma6Q9QUM9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Psma6Q9QUM9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Psma6Q9QUM9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Psma6Q9QUM9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Psma6Q9QUM9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psma6Q9QUM9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psma6Q9QUM9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Psma6Q9QUM9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Psma6Q9QUM9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Psma6Q9QUM9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Psma6Q9QUM9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psma6Q9QUM9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psma6Q9QUM9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Psma6Q9QUM9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Psma6Q9QUM9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psma6Q9QUM9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psma6Q9QUM9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psma6Q9QUM9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psma6Q9QUM9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Psma6Q9QUM9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psma6Q9QUM9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psma6Q9QUM9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psma6Q9QUM9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psma6Q9QUM9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psma6Q9QUM9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psma6Q9QUM9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psma6Q9QUM9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psma6Q9QUM9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psma6Q9QUM9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psma6Q9QUM9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psma6Q9QUM9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms