Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hdgfl3Q9JMG7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hdgfl3Q9JMG7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hdgfl3Q9JMG7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hdgfl3Q9JMG7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hdgfl3Q9JMG7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdgfl3Q9JMG7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdgfl3Q9JMG7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdgfl3Q9JMG7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdgfl3Q9JMG7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hdgfl3Q9JMG7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hdgfl3Q9JMG7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hdgfl3Q9JMG7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hdgfl3Q9JMG7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdgfl3Q9JMG7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdgfl3Q9JMG7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdgfl3Q9JMG7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdgfl3Q9JMG7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdgfl3Q9JMG7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdgfl3Q9JMG7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdgfl3Q9JMG7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdgfl3Q9JMG7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdgfl3Q9JMG7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdgfl3Q9JMG7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdgfl3Q9JMG7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdgfl3Q9JMG7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdgfl3Q9JMG7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdgfl3Q9JMG7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdgfl3Q9JMG7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdgfl3Q9JMG7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdgfl3Q9JMG7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdgfl3Q9JMG7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdgfl3Q9JMG7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hdgfl3Q9JMG7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdgfl3Q9JMG7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdgfl3Q9JMG7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdgfl3Q9JMG7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hdgfl3Q9JMG7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdgfl3Q9JMG7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdgfl3Q9JMG7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdgfl3Q9JMG7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hdgfl3Q9JMG7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdgfl3Q9JMG7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdgfl3Q9JMG7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdgfl3Q9JMG7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdgfl3Q9JMG7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdgfl3Q9JMG7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hdgfl3Q9JMG7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hdgfl3Q9JMG7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hdgfl3Q9JMG7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hdgfl3Q9JMG7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hdgfl3Q9JMG7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hdgfl3Q9JMG7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hdgfl3Q9JMG7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Hdgfl3Q9JMG7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hdgfl3Q9JMG7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hdgfl3Q9JMG7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hdgfl3Q9JMG7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hdgfl3Q9JMG7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hdgfl3Q9JMG7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hdgfl3Q9JMG7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hdgfl3Q9JMG7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hdgfl3Q9JMG7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hdgfl3Q9JMG7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hdgfl3Q9JMG7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hdgfl3Q9JMG7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hdgfl3Q9JMG7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Hdgfl3Q9JMG7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hdgfl3Q9JMG7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hdgfl3Q9JMG7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hdgfl3Q9JMG7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hdgfl3Q9JMG7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hdgfl3Q9JMG7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hdgfl3Q9JMG7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hdgfl3Q9JMG7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hdgfl3Q9JMG7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Hdgfl3Q9JMG7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hdgfl3Q9JMG7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hdgfl3Q9JMG7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Hdgfl3Q9JMG7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hdgfl3Q9JMG7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hdgfl3Q9JMG7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hdgfl3Q9JMG7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hdgfl3Q9JMG7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hdgfl3Q9JMG7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Hdgfl3Q9JMG7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hdgfl3Q9JMG7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hdgfl3Q9JMG7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hdgfl3Q9JMG7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hdgfl3Q9JMG7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hdgfl3Q9JMG7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hdgfl3Q9JMG7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hdgfl3Q9JMG7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hdgfl3Q9JMG7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hdgfl3Q9JMG7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hdgfl3Q9JMG7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hdgfl3Q9JMG7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Hdgfl3Q9JMG7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms