Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC3

Dnaja4, DnaJ homolog subfamily A member 4, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja4Q9JMC3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnaja4Q9JMC3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnaja4Q9JMC3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnaja4Q9JMC3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnaja4Q9JMC3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnaja4Q9JMC3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnaja4Q9JMC3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnaja4Q9JMC3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnaja4Q9JMC3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnaja4Q9JMC3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnaja4Q9JMC3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnaja4Q9JMC3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnaja4Q9JMC3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnaja4Q9JMC3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnaja4Q9JMC3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnaja4Q9JMC3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dnaja4Q9JMC3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dnaja4Q9JMC3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dnaja4Q9JMC3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dnaja4Q9JMC3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Dnaja4Q9JMC3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Dnaja4Q9JMC3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Dnaja4Q9JMC3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnaja4Q9JMC3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnaja4Q9JMC3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnaja4Q9JMC3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dnaja4Q9JMC3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dnaja4Q9JMC3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Dnaja4Q9JMC3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dnaja4Q9JMC3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnaja4Q9JMC3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnaja4Q9JMC3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnaja4Q9JMC3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dnaja4Q9JMC3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnaja4Q9JMC3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dnaja4Q9JMC3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnaja4Q9JMC3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnaja4Q9JMC3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnaja4Q9JMC3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dnaja4Q9JMC3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dnaja4Q9JMC3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dnaja4Q9JMC3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms