Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Cabp1Q9JLK7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Cabp1Q9JLK7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Cabp1Q9JLK7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Cabp1Q9JLK7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Cabp1Q9JLK7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Cabp1Q9JLK7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Cabp1Q9JLK7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Cabp1Q9JLK7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Cabp1Q9JLK7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Cabp1Q9JLK7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Cabp1Q9JLK7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Cabp1Q9JLK7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Cabp1Q9JLK7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Cabp1Q9JLK7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Cabp1Q9JLK7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Cabp1Q9JLK7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Cabp1Q9JLK7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Cabp1Q9JLK7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Cabp1Q9JLK7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Cabp1Q9JLK7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Cabp1Q9JLK7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Cabp1Q9JLK7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Cabp1Q9JLK7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Cabp1Q9JLK7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
Cabp1Q9JLK7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Cabp1Q9JLK7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Cabp1Q9JLK7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Cabp1Q9JLK7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Cabp1Q9JLK7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Cabp1Q9JLK7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Cabp1Q9JLK7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Cabp1Q9JLK7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Cabp1Q9JLK7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Cabp1Q9JLK7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Cabp1Q9JLK7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Cabp1Q9JLK7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Cabp1Q9JLK7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Cabp1Q9JLK7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Cabp1Q9JLK7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
Cabp1Q9JLK7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
Cabp1Q9JLK7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Cabp1Q9JLK7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Cabp1Q9JLK7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Cabp1Q9JLK7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
Cabp1Q9JLK7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Cabp1Q9JLK7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Cabp1Q9JLK7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
Cabp1Q9JLK7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Cabp1Q9JLK7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
Cabp1Q9JLK7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Cabp1Q9JLK7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Cabp1Q9JLK7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
Cabp1Q9JLK7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Cabp1Q9JLK7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Cabp1Q9JLK7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Cabp1Q9JLK7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Cabp1Q9JLK7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
Cabp1Q9JLK7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Cabp1Q9JLK7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Cabp1Q9JLK7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Cabp1Q9JLK7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Cabp1Q9JLK7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Cabp1Q9JLK7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Cabp1Q9JLK7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Cabp1Q9JLK7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Cabp1Q9JLK7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Cabp1Q9JLK7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Cabp1Q9JLK7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
Cabp1Q9JLK7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Cabp1Q9JLK7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Cabp1Q9JLK7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Cabp1Q9JLK7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Cabp1Q9JLK7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Cabp1Q9JLK7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Cabp1Q9JLK7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Cabp1Q9JLK7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
Cabp1Q9JLK7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Cabp1Q9JLK7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Cabp1Q9JLK7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Cabp1Q9JLK7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
Cabp1Q9JLK7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Cabp1Q9JLK7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Cabp1Q9JLK7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Cabp1Q9JLK7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC35■■■■□ 3.19
Cabp1Q9JLK7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Cabp1Q9JLK7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Cabp1Q9JLK7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Cabp1Q9JLK7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Cabp1Q9JLK7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Cabp1Q9JLK7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Cabp1Q9JLK7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
Cabp1Q9JLK7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Cabp1Q9JLK7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
Cabp1Q9JLK7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
Cabp1Q9JLK7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Cabp1Q9JLK7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Cabp1Q9JLK7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Cabp1Q9JLK7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Cabp1Q9JLK7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms