Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL21

Ccr10, C-C chemokine receptor type 10, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr10Q9JL21 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccr10Q9JL21 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccr10Q9JL21 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccr10Q9JL21 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccr10Q9JL21 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccr10Q9JL21 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccr10Q9JL21 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccr10Q9JL21 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccr10Q9JL21 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccr10Q9JL21 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccr10Q9JL21 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccr10Q9JL21 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccr10Q9JL21 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccr10Q9JL21 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccr10Q9JL21 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccr10Q9JL21 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccr10Q9JL21 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccr10Q9JL21 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccr10Q9JL21 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccr10Q9JL21 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccr10Q9JL21 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccr10Q9JL21 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccr10Q9JL21 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccr10Q9JL21 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccr10Q9JL21 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccr10Q9JL21 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccr10Q9JL21 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccr10Q9JL21 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccr10Q9JL21 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccr10Q9JL21 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccr10Q9JL21 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccr10Q9JL21 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccr10Q9JL21 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccr10Q9JL21 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccr10Q9JL21 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccr10Q9JL21 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccr10Q9JL21 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccr10Q9JL21 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccr10Q9JL21 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccr10Q9JL21 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccr10Q9JL21 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccr10Q9JL21 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccr10Q9JL21 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccr10Q9JL21 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccr10Q9JL21 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccr10Q9JL21 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccr10Q9JL21 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccr10Q9JL21 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccr10Q9JL21 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccr10Q9JL21 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccr10Q9JL21 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccr10Q9JL21 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccr10Q9JL21 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccr10Q9JL21 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccr10Q9JL21 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccr10Q9JL21 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccr10Q9JL21 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccr10Q9JL21 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccr10Q9JL21 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccr10Q9JL21 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccr10Q9JL21 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccr10Q9JL21 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccr10Q9JL21 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccr10Q9JL21 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccr10Q9JL21 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccr10Q9JL21 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccr10Q9JL21 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccr10Q9JL21 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccr10Q9JL21 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccr10Q9JL21 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccr10Q9JL21 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccr10Q9JL21 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccr10Q9JL21 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccr10Q9JL21 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccr10Q9JL21 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccr10Q9JL21 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccr10Q9JL21 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccr10Q9JL21 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccr10Q9JL21 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccr10Q9JL21 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccr10Q9JL21 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccr10Q9JL21 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccr10Q9JL21 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccr10Q9JL21 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccr10Q9JL21 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccr10Q9JL21 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccr10Q9JL21 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccr10Q9JL21 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccr10Q9JL21 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccr10Q9JL21 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccr10Q9JL21 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccr10Q9JL21 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccr10Q9JL21 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccr10Q9JL21 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccr10Q9JL21 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccr10Q9JL21 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccr10Q9JL21 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccr10Q9JL21 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccr10Q9JL21 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccr10Q9JL21 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms