Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKU8

Lmx1a, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1aQ9JKU8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmx1aQ9JKU8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmx1aQ9JKU8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lmx1aQ9JKU8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Lmx1aQ9JKU8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Lmx1aQ9JKU8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmx1aQ9JKU8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmx1aQ9JKU8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmx1aQ9JKU8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmx1aQ9JKU8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lmx1aQ9JKU8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lmx1aQ9JKU8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Lmx1aQ9JKU8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Lmx1aQ9JKU8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmx1aQ9JKU8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmx1aQ9JKU8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmx1aQ9JKU8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmx1aQ9JKU8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmx1aQ9JKU8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmx1aQ9JKU8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmx1aQ9JKU8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmx1aQ9JKU8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lmx1aQ9JKU8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lmx1aQ9JKU8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lmx1aQ9JKU8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lmx1aQ9JKU8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lmx1aQ9JKU8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lmx1aQ9JKU8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lmx1aQ9JKU8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lmx1aQ9JKU8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lmx1aQ9JKU8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lmx1aQ9JKU8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lmx1aQ9JKU8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lmx1aQ9JKU8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lmx1aQ9JKU8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lmx1aQ9JKU8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lmx1aQ9JKU8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lmx1aQ9JKU8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lmx1aQ9JKU8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lmx1aQ9JKU8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lmx1aQ9JKU8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lmx1aQ9JKU8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Lmx1aQ9JKU8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lmx1aQ9JKU8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lmx1aQ9JKU8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lmx1aQ9JKU8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lmx1aQ9JKU8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lmx1aQ9JKU8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lmx1aQ9JKU8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lmx1aQ9JKU8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmx1aQ9JKU8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmx1aQ9JKU8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmx1aQ9JKU8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmx1aQ9JKU8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmx1aQ9JKU8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmx1aQ9JKU8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lmx1aQ9JKU8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lmx1aQ9JKU8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmx1aQ9JKU8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmx1aQ9JKU8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmx1aQ9JKU8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lmx1aQ9JKU8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmx1aQ9JKU8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmx1aQ9JKU8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmx1aQ9JKU8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmx1aQ9JKU8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Lmx1aQ9JKU8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lmx1aQ9JKU8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmx1aQ9JKU8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmx1aQ9JKU8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmx1aQ9JKU8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmx1aQ9JKU8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lmx1aQ9JKU8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lmx1aQ9JKU8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lmx1aQ9JKU8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lmx1aQ9JKU8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmx1aQ9JKU8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmx1aQ9JKU8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmx1aQ9JKU8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmx1aQ9JKU8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lmx1aQ9JKU8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lmx1aQ9JKU8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lmx1aQ9JKU8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmx1aQ9JKU8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmx1aQ9JKU8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmx1aQ9JKU8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmx1aQ9JKU8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmx1aQ9JKU8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lmx1aQ9JKU8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmx1aQ9JKU8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmx1aQ9JKU8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmx1aQ9JKU8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmx1aQ9JKU8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmx1aQ9JKU8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmx1aQ9JKU8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmx1aQ9JKU8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmx1aQ9JKU8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmx1aQ9JKU8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmx1aQ9JKU8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmx1aQ9JKU8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms