Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tmod2Q9JKK7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tmod2Q9JKK7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Tmod2Q9JKK7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tmod2Q9JKK7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tmod2Q9JKK7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Tmod2Q9JKK7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tmod2Q9JKK7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tmod2Q9JKK7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tmod2Q9JKK7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tmod2Q9JKK7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tmod2Q9JKK7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tmod2Q9JKK7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tmod2Q9JKK7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tmod2Q9JKK7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tmod2Q9JKK7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tmod2Q9JKK7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tmod2Q9JKK7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tmod2Q9JKK7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tmod2Q9JKK7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Tmod2Q9JKK7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Tmod2Q9JKK7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tmod2Q9JKK7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tmod2Q9JKK7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Tmod2Q9JKK7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Tmod2Q9JKK7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Tmod2Q9JKK7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tmod2Q9JKK7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tmod2Q9JKK7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tmod2Q9JKK7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tmod2Q9JKK7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tmod2Q9JKK7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Tmod2Q9JKK7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tmod2Q9JKK7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tmod2Q9JKK7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tmod2Q9JKK7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tmod2Q9JKK7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tmod2Q9JKK7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Tmod2Q9JKK7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tmod2Q9JKK7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tmod2Q9JKK7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tmod2Q9JKK7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tmod2Q9JKK7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tmod2Q9JKK7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tmod2Q9JKK7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tmod2Q9JKK7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tmod2Q9JKK7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tmod2Q9JKK7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tmod2Q9JKK7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tmod2Q9JKK7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tmod2Q9JKK7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tmod2Q9JKK7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tmod2Q9JKK7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tmod2Q9JKK7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tmod2Q9JKK7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Tmod2Q9JKK7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Tmod2Q9JKK7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tmod2Q9JKK7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tmod2Q9JKK7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tmod2Q9JKK7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tmod2Q9JKK7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tmod2Q9JKK7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tmod2Q9JKK7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tmod2Q9JKK7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tmod2Q9JKK7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tmod2Q9JKK7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tmod2Q9JKK7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tmod2Q9JKK7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tmod2Q9JKK7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tmod2Q9JKK7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tmod2Q9JKK7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tmod2Q9JKK7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tmod2Q9JKK7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tmod2Q9JKK7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Tmod2Q9JKK7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tmod2Q9JKK7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Tmod2Q9JKK7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Tmod2Q9JKK7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Tmod2Q9JKK7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tmod2Q9JKK7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Tmod2Q9JKK7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Tmod2Q9JKK7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Tmod2Q9JKK7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Tmod2Q9JKK7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tmod2Q9JKK7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tmod2Q9JKK7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tmod2Q9JKK7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tmod2Q9JKK7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Tmod2Q9JKK7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tmod2Q9JKK7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tmod2Q9JKK7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tmod2Q9JKK7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Tmod2Q9JKK7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tmod2Q9JKK7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tmod2Q9JKK7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tmod2Q9JKK7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tmod2Q9JKK7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tmod2Q9JKK7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tmod2Q9JKK7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tmod2Q9JKK7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms