Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gpa33Q9JKA5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gpa33Q9JKA5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gpa33Q9JKA5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpa33Q9JKA5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpa33Q9JKA5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpa33Q9JKA5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpa33Q9JKA5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpa33Q9JKA5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpa33Q9JKA5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpa33Q9JKA5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpa33Q9JKA5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpa33Q9JKA5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gpa33Q9JKA5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gpa33Q9JKA5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gpa33Q9JKA5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gpa33Q9JKA5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gpa33Q9JKA5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gpa33Q9JKA5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gpa33Q9JKA5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gpa33Q9JKA5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gpa33Q9JKA5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gpa33Q9JKA5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gpa33Q9JKA5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gpa33Q9JKA5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gpa33Q9JKA5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gpa33Q9JKA5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gpa33Q9JKA5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gpa33Q9JKA5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gpa33Q9JKA5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gpa33Q9JKA5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gpa33Q9JKA5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gpa33Q9JKA5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gpa33Q9JKA5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gpa33Q9JKA5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gpa33Q9JKA5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gpa33Q9JKA5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gpa33Q9JKA5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gpa33Q9JKA5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gpa33Q9JKA5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gpa33Q9JKA5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gpa33Q9JKA5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gpa33Q9JKA5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gpa33Q9JKA5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gpa33Q9JKA5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gpa33Q9JKA5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gpa33Q9JKA5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gpa33Q9JKA5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gpa33Q9JKA5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gpa33Q9JKA5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gpa33Q9JKA5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gpa33Q9JKA5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gpa33Q9JKA5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gpa33Q9JKA5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gpa33Q9JKA5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gpa33Q9JKA5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gpa33Q9JKA5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gpa33Q9JKA5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gpa33Q9JKA5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gpa33Q9JKA5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpa33Q9JKA5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpa33Q9JKA5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpa33Q9JKA5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpa33Q9JKA5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpa33Q9JKA5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpa33Q9JKA5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpa33Q9JKA5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpa33Q9JKA5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpa33Q9JKA5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpa33Q9JKA5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpa33Q9JKA5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpa33Q9JKA5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gpa33Q9JKA5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpa33Q9JKA5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpa33Q9JKA5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpa33Q9JKA5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpa33Q9JKA5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpa33Q9JKA5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpa33Q9JKA5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpa33Q9JKA5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpa33Q9JKA5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpa33Q9JKA5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpa33Q9JKA5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpa33Q9JKA5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpa33Q9JKA5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpa33Q9JKA5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpa33Q9JKA5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpa33Q9JKA5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpa33Q9JKA5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpa33Q9JKA5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpa33Q9JKA5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gpa33Q9JKA5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpa33Q9JKA5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpa33Q9JKA5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gpa33Q9JKA5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpa33Q9JKA5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gpa33Q9JKA5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Gpa33Q9JKA5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gpa33Q9JKA5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gpa33Q9JKA5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms