Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tuba8Q9JJZ2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tuba8Q9JJZ2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tuba8Q9JJZ2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tuba8Q9JJZ2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tuba8Q9JJZ2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tuba8Q9JJZ2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tuba8Q9JJZ2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tuba8Q9JJZ2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tuba8Q9JJZ2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tuba8Q9JJZ2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tuba8Q9JJZ2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tuba8Q9JJZ2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tuba8Q9JJZ2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tuba8Q9JJZ2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tuba8Q9JJZ2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tuba8Q9JJZ2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tuba8Q9JJZ2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tuba8Q9JJZ2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tuba8Q9JJZ2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tuba8Q9JJZ2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tuba8Q9JJZ2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tuba8Q9JJZ2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tuba8Q9JJZ2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tuba8Q9JJZ2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tuba8Q9JJZ2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tuba8Q9JJZ2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tuba8Q9JJZ2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tuba8Q9JJZ2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tuba8Q9JJZ2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tuba8Q9JJZ2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tuba8Q9JJZ2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tuba8Q9JJZ2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tuba8Q9JJZ2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tuba8Q9JJZ2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tuba8Q9JJZ2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tuba8Q9JJZ2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tuba8Q9JJZ2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tuba8Q9JJZ2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tuba8Q9JJZ2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tuba8Q9JJZ2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tuba8Q9JJZ2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tuba8Q9JJZ2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tuba8Q9JJZ2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tuba8Q9JJZ2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tuba8Q9JJZ2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tuba8Q9JJZ2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tuba8Q9JJZ2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tuba8Q9JJZ2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tuba8Q9JJZ2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tuba8Q9JJZ2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tuba8Q9JJZ2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tuba8Q9JJZ2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tuba8Q9JJZ2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tuba8Q9JJZ2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tuba8Q9JJZ2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tuba8Q9JJZ2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tuba8Q9JJZ2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tuba8Q9JJZ2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tuba8Q9JJZ2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tuba8Q9JJZ2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tuba8Q9JJZ2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tuba8Q9JJZ2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tuba8Q9JJZ2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tuba8Q9JJZ2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tuba8Q9JJZ2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tuba8Q9JJZ2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tuba8Q9JJZ2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tuba8Q9JJZ2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tuba8Q9JJZ2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tuba8Q9JJZ2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tuba8Q9JJZ2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tuba8Q9JJZ2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tuba8Q9JJZ2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tuba8Q9JJZ2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tuba8Q9JJZ2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tuba8Q9JJZ2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tuba8Q9JJZ2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tuba8Q9JJZ2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tuba8Q9JJZ2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tuba8Q9JJZ2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tuba8Q9JJZ2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tuba8Q9JJZ2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tuba8Q9JJZ2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tuba8Q9JJZ2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tuba8Q9JJZ2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tuba8Q9JJZ2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tuba8Q9JJZ2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tuba8Q9JJZ2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tuba8Q9JJZ2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tuba8Q9JJZ2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tuba8Q9JJZ2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tuba8Q9JJZ2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tuba8Q9JJZ2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tuba8Q9JJZ2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tuba8Q9JJZ2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tuba8Q9JJZ2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tuba8Q9JJZ2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tuba8Q9JJZ2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tuba8Q9JJZ2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms