Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN5

Cpn1, Carboxypeptidase N catalytic chain, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpn1Q9JJN5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cpn1Q9JJN5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cpn1Q9JJN5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cpn1Q9JJN5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cpn1Q9JJN5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cpn1Q9JJN5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cpn1Q9JJN5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cpn1Q9JJN5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cpn1Q9JJN5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cpn1Q9JJN5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cpn1Q9JJN5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cpn1Q9JJN5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpn1Q9JJN5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpn1Q9JJN5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cpn1Q9JJN5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cpn1Q9JJN5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cpn1Q9JJN5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpn1Q9JJN5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpn1Q9JJN5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpn1Q9JJN5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpn1Q9JJN5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cpn1Q9JJN5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cpn1Q9JJN5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cpn1Q9JJN5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cpn1Q9JJN5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cpn1Q9JJN5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cpn1Q9JJN5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cpn1Q9JJN5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cpn1Q9JJN5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cpn1Q9JJN5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cpn1Q9JJN5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cpn1Q9JJN5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cpn1Q9JJN5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cpn1Q9JJN5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cpn1Q9JJN5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cpn1Q9JJN5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cpn1Q9JJN5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cpn1Q9JJN5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cpn1Q9JJN5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cpn1Q9JJN5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cpn1Q9JJN5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpn1Q9JJN5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpn1Q9JJN5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpn1Q9JJN5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cpn1Q9JJN5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cpn1Q9JJN5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cpn1Q9JJN5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cpn1Q9JJN5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cpn1Q9JJN5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cpn1Q9JJN5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cpn1Q9JJN5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cpn1Q9JJN5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cpn1Q9JJN5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cpn1Q9JJN5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cpn1Q9JJN5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cpn1Q9JJN5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cpn1Q9JJN5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cpn1Q9JJN5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cpn1Q9JJN5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cpn1Q9JJN5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cpn1Q9JJN5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cpn1Q9JJN5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cpn1Q9JJN5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cpn1Q9JJN5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cpn1Q9JJN5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cpn1Q9JJN5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cpn1Q9JJN5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cpn1Q9JJN5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cpn1Q9JJN5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cpn1Q9JJN5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cpn1Q9JJN5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cpn1Q9JJN5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cpn1Q9JJN5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cpn1Q9JJN5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cpn1Q9JJN5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cpn1Q9JJN5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cpn1Q9JJN5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cpn1Q9JJN5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cpn1Q9JJN5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cpn1Q9JJN5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cpn1Q9JJN5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cpn1Q9JJN5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cpn1Q9JJN5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cpn1Q9JJN5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cpn1Q9JJN5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cpn1Q9JJN5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cpn1Q9JJN5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cpn1Q9JJN5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cpn1Q9JJN5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cpn1Q9JJN5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpn1Q9JJN5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpn1Q9JJN5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpn1Q9JJN5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpn1Q9JJN5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpn1Q9JJN5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpn1Q9JJN5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cpn1Q9JJN5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cpn1Q9JJN5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cpn1Q9JJN5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cpn1Q9JJN5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms