Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc12a4Q9JIS8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc12a4Q9JIS8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc12a4Q9JIS8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc12a4Q9JIS8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc12a4Q9JIS8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc12a4Q9JIS8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc12a4Q9JIS8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc12a4Q9JIS8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc12a4Q9JIS8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc12a4Q9JIS8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc12a4Q9JIS8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc12a4Q9JIS8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc12a4Q9JIS8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc12a4Q9JIS8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc12a4Q9JIS8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc12a4Q9JIS8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc12a4Q9JIS8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc12a4Q9JIS8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc12a4Q9JIS8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc12a4Q9JIS8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc12a4Q9JIS8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc12a4Q9JIS8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc12a4Q9JIS8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc12a4Q9JIS8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc12a4Q9JIS8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc12a4Q9JIS8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc12a4Q9JIS8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc12a4Q9JIS8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc12a4Q9JIS8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc12a4Q9JIS8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc12a4Q9JIS8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc12a4Q9JIS8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc12a4Q9JIS8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc12a4Q9JIS8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc12a4Q9JIS8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc12a4Q9JIS8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc12a4Q9JIS8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc12a4Q9JIS8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc12a4Q9JIS8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc12a4Q9JIS8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc12a4Q9JIS8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc12a4Q9JIS8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc12a4Q9JIS8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc12a4Q9JIS8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc12a4Q9JIS8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc12a4Q9JIS8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc12a4Q9JIS8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc12a4Q9JIS8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc12a4Q9JIS8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc12a4Q9JIS8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc12a4Q9JIS8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc12a4Q9JIS8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc12a4Q9JIS8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc12a4Q9JIS8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc12a4Q9JIS8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc12a4Q9JIS8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc12a4Q9JIS8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc12a4Q9JIS8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc12a4Q9JIS8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc12a4Q9JIS8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc12a4Q9JIS8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc12a4Q9JIS8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc12a4Q9JIS8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc12a4Q9JIS8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc12a4Q9JIS8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Slc12a4Q9JIS8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc12a4Q9JIS8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc12a4Q9JIS8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc12a4Q9JIS8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc12a4Q9JIS8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc12a4Q9JIS8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc12a4Q9JIS8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc12a4Q9JIS8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc12a4Q9JIS8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc12a4Q9JIS8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc12a4Q9JIS8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc12a4Q9JIS8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc12a4Q9JIS8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc12a4Q9JIS8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc12a4Q9JIS8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc12a4Q9JIS8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc12a4Q9JIS8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc12a4Q9JIS8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc12a4Q9JIS8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc12a4Q9JIS8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc12a4Q9JIS8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc12a4Q9JIS8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc12a4Q9JIS8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc12a4Q9JIS8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc12a4Q9JIS8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc12a4Q9JIS8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc12a4Q9JIS8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc12a4Q9JIS8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc12a4Q9JIS8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc12a4Q9JIS8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc12a4Q9JIS8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc12a4Q9JIS8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc12a4Q9JIS8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc12a4Q9JIS8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms