Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc22Q9JIG7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc22Q9JIG7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc22Q9JIG7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc22Q9JIG7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc22Q9JIG7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc22Q9JIG7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc22Q9JIG7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc22Q9JIG7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc22Q9JIG7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc22Q9JIG7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc22Q9JIG7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc22Q9JIG7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc22Q9JIG7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc22Q9JIG7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc22Q9JIG7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc22Q9JIG7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc22Q9JIG7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc22Q9JIG7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc22Q9JIG7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc22Q9JIG7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc22Q9JIG7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc22Q9JIG7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc22Q9JIG7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc22Q9JIG7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc22Q9JIG7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc22Q9JIG7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc22Q9JIG7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc22Q9JIG7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc22Q9JIG7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc22Q9JIG7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc22Q9JIG7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc22Q9JIG7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc22Q9JIG7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc22Q9JIG7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc22Q9JIG7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc22Q9JIG7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc22Q9JIG7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc22Q9JIG7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc22Q9JIG7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc22Q9JIG7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc22Q9JIG7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc22Q9JIG7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc22Q9JIG7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc22Q9JIG7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc22Q9JIG7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc22Q9JIG7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc22Q9JIG7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc22Q9JIG7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc22Q9JIG7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc22Q9JIG7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc22Q9JIG7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc22Q9JIG7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc22Q9JIG7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc22Q9JIG7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc22Q9JIG7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc22Q9JIG7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc22Q9JIG7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc22Q9JIG7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc22Q9JIG7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc22Q9JIG7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc22Q9JIG7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc22Q9JIG7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc22Q9JIG7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc22Q9JIG7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc22Q9JIG7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc22Q9JIG7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc22Q9JIG7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc22Q9JIG7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc22Q9JIG7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc22Q9JIG7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc22Q9JIG7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc22Q9JIG7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc22Q9JIG7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc22Q9JIG7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc22Q9JIG7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc22Q9JIG7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc22Q9JIG7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc22Q9JIG7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc22Q9JIG7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc22Q9JIG7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc22Q9JIG7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc22Q9JIG7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc22Q9JIG7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc22Q9JIG7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc22Q9JIG7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc22Q9JIG7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc22Q9JIG7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc22Q9JIG7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc22Q9JIG7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc22Q9JIG7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc22Q9JIG7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc22Q9JIG7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc22Q9JIG7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc22Q9JIG7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc22Q9JIG7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc22Q9JIG7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc22Q9JIG7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc22Q9JIG7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc22Q9JIG7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.5 ms