Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RabggtaQ9JHK4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RabggtaQ9JHK4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RabggtaQ9JHK4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RabggtaQ9JHK4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RabggtaQ9JHK4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RabggtaQ9JHK4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RabggtaQ9JHK4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RabggtaQ9JHK4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RabggtaQ9JHK4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RabggtaQ9JHK4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RabggtaQ9JHK4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RabggtaQ9JHK4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RabggtaQ9JHK4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RabggtaQ9JHK4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RabggtaQ9JHK4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RabggtaQ9JHK4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RabggtaQ9JHK4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RabggtaQ9JHK4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RabggtaQ9JHK4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RabggtaQ9JHK4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RabggtaQ9JHK4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RabggtaQ9JHK4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RabggtaQ9JHK4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RabggtaQ9JHK4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RabggtaQ9JHK4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RabggtaQ9JHK4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RabggtaQ9JHK4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RabggtaQ9JHK4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RabggtaQ9JHK4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RabggtaQ9JHK4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RabggtaQ9JHK4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RabggtaQ9JHK4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RabggtaQ9JHK4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RabggtaQ9JHK4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RabggtaQ9JHK4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RabggtaQ9JHK4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RabggtaQ9JHK4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RabggtaQ9JHK4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RabggtaQ9JHK4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RabggtaQ9JHK4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RabggtaQ9JHK4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RabggtaQ9JHK4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RabggtaQ9JHK4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RabggtaQ9JHK4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RabggtaQ9JHK4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RabggtaQ9JHK4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RabggtaQ9JHK4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RabggtaQ9JHK4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RabggtaQ9JHK4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RabggtaQ9JHK4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RabggtaQ9JHK4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RabggtaQ9JHK4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RabggtaQ9JHK4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RabggtaQ9JHK4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RabggtaQ9JHK4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RabggtaQ9JHK4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RabggtaQ9JHK4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RabggtaQ9JHK4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RabggtaQ9JHK4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RabggtaQ9JHK4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RabggtaQ9JHK4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RabggtaQ9JHK4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RabggtaQ9JHK4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RabggtaQ9JHK4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RabggtaQ9JHK4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RabggtaQ9JHK4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RabggtaQ9JHK4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RabggtaQ9JHK4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RabggtaQ9JHK4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RabggtaQ9JHK4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RabggtaQ9JHK4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RabggtaQ9JHK4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RabggtaQ9JHK4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RabggtaQ9JHK4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RabggtaQ9JHK4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RabggtaQ9JHK4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RabggtaQ9JHK4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
RabggtaQ9JHK4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RabggtaQ9JHK4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RabggtaQ9JHK4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RabggtaQ9JHK4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RabggtaQ9JHK4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RabggtaQ9JHK4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RabggtaQ9JHK4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RabggtaQ9JHK4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RabggtaQ9JHK4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RabggtaQ9JHK4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RabggtaQ9JHK4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RabggtaQ9JHK4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RabggtaQ9JHK4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RabggtaQ9JHK4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RabggtaQ9JHK4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RabggtaQ9JHK4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RabggtaQ9JHK4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RabggtaQ9JHK4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RabggtaQ9JHK4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RabggtaQ9JHK4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RabggtaQ9JHK4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms