Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK3

Capn10, Calpain-10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn10Q9ESK3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Capn10Q9ESK3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Capn10Q9ESK3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Capn10Q9ESK3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Capn10Q9ESK3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Capn10Q9ESK3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Capn10Q9ESK3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Capn10Q9ESK3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Capn10Q9ESK3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Capn10Q9ESK3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Capn10Q9ESK3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Capn10Q9ESK3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Capn10Q9ESK3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Capn10Q9ESK3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Capn10Q9ESK3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Capn10Q9ESK3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Capn10Q9ESK3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Capn10Q9ESK3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Capn10Q9ESK3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Capn10Q9ESK3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Capn10Q9ESK3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Capn10Q9ESK3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Capn10Q9ESK3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Capn10Q9ESK3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Capn10Q9ESK3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Capn10Q9ESK3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Capn10Q9ESK3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Capn10Q9ESK3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Capn10Q9ESK3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Capn10Q9ESK3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Capn10Q9ESK3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Capn10Q9ESK3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Capn10Q9ESK3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Capn10Q9ESK3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Capn10Q9ESK3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Capn10Q9ESK3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Capn10Q9ESK3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Capn10Q9ESK3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Capn10Q9ESK3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Capn10Q9ESK3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Capn10Q9ESK3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Capn10Q9ESK3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Capn10Q9ESK3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Capn10Q9ESK3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Capn10Q9ESK3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Capn10Q9ESK3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Capn10Q9ESK3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Capn10Q9ESK3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Capn10Q9ESK3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Capn10Q9ESK3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Capn10Q9ESK3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Capn10Q9ESK3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Capn10Q9ESK3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Capn10Q9ESK3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Capn10Q9ESK3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Capn10Q9ESK3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Capn10Q9ESK3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Capn10Q9ESK3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Capn10Q9ESK3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Capn10Q9ESK3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Capn10Q9ESK3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Capn10Q9ESK3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Capn10Q9ESK3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Capn10Q9ESK3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Capn10Q9ESK3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Capn10Q9ESK3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Capn10Q9ESK3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Capn10Q9ESK3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Capn10Q9ESK3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Capn10Q9ESK3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Capn10Q9ESK3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Capn10Q9ESK3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Capn10Q9ESK3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Capn10Q9ESK3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Capn10Q9ESK3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Capn10Q9ESK3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Capn10Q9ESK3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Capn10Q9ESK3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Capn10Q9ESK3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Capn10Q9ESK3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Capn10Q9ESK3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Capn10Q9ESK3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Capn10Q9ESK3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Capn10Q9ESK3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Capn10Q9ESK3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Capn10Q9ESK3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Capn10Q9ESK3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Capn10Q9ESK3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Capn10Q9ESK3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Capn10Q9ESK3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Capn10Q9ESK3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Capn10Q9ESK3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Capn10Q9ESK3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Capn10Q9ESK3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Capn10Q9ESK3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Capn10Q9ESK3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Capn10Q9ESK3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Capn10Q9ESK3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Capn10Q9ESK3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Capn10Q9ESK3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms