Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG4

Tmem27, Collectrin, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem27Q9ESG4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmem27Q9ESG4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmem27Q9ESG4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmem27Q9ESG4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmem27Q9ESG4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmem27Q9ESG4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmem27Q9ESG4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmem27Q9ESG4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmem27Q9ESG4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmem27Q9ESG4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmem27Q9ESG4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmem27Q9ESG4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmem27Q9ESG4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tmem27Q9ESG4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmem27Q9ESG4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmem27Q9ESG4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmem27Q9ESG4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmem27Q9ESG4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmem27Q9ESG4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmem27Q9ESG4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmem27Q9ESG4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmem27Q9ESG4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmem27Q9ESG4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmem27Q9ESG4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmem27Q9ESG4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmem27Q9ESG4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmem27Q9ESG4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmem27Q9ESG4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tmem27Q9ESG4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmem27Q9ESG4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmem27Q9ESG4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmem27Q9ESG4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmem27Q9ESG4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmem27Q9ESG4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmem27Q9ESG4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmem27Q9ESG4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmem27Q9ESG4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmem27Q9ESG4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmem27Q9ESG4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmem27Q9ESG4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmem27Q9ESG4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmem27Q9ESG4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmem27Q9ESG4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmem27Q9ESG4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmem27Q9ESG4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmem27Q9ESG4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmem27Q9ESG4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmem27Q9ESG4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmem27Q9ESG4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem27Q9ESG4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem27Q9ESG4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem27Q9ESG4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem27Q9ESG4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmem27Q9ESG4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmem27Q9ESG4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmem27Q9ESG4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmem27Q9ESG4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmem27Q9ESG4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmem27Q9ESG4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmem27Q9ESG4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmem27Q9ESG4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmem27Q9ESG4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmem27Q9ESG4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmem27Q9ESG4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmem27Q9ESG4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmem27Q9ESG4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmem27Q9ESG4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmem27Q9ESG4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmem27Q9ESG4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmem27Q9ESG4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmem27Q9ESG4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmem27Q9ESG4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmem27Q9ESG4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmem27Q9ESG4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmem27Q9ESG4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmem27Q9ESG4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmem27Q9ESG4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmem27Q9ESG4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmem27Q9ESG4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmem27Q9ESG4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmem27Q9ESG4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmem27Q9ESG4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmem27Q9ESG4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmem27Q9ESG4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmem27Q9ESG4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmem27Q9ESG4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmem27Q9ESG4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmem27Q9ESG4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmem27Q9ESG4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmem27Q9ESG4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmem27Q9ESG4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmem27Q9ESG4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmem27Q9ESG4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmem27Q9ESG4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmem27Q9ESG4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmem27Q9ESG4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmem27Q9ESG4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tmem27Q9ESG4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmem27Q9ESG4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmem27Q9ESG4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms