Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OtofQ9ESF1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OtofQ9ESF1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OtofQ9ESF1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OtofQ9ESF1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OtofQ9ESF1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
OtofQ9ESF1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OtofQ9ESF1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24■■□□□ 1.43
OtofQ9ESF1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OtofQ9ESF1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OtofQ9ESF1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OtofQ9ESF1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
OtofQ9ESF1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
OtofQ9ESF1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OtofQ9ESF1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OtofQ9ESF1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
OtofQ9ESF1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OtofQ9ESF1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OtofQ9ESF1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OtofQ9ESF1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OtofQ9ESF1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OtofQ9ESF1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OtofQ9ESF1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OtofQ9ESF1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OtofQ9ESF1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OtofQ9ESF1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OtofQ9ESF1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OtofQ9ESF1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OtofQ9ESF1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OtofQ9ESF1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OtofQ9ESF1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OtofQ9ESF1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OtofQ9ESF1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OtofQ9ESF1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
OtofQ9ESF1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OtofQ9ESF1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
OtofQ9ESF1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OtofQ9ESF1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
OtofQ9ESF1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
OtofQ9ESF1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OtofQ9ESF1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OtofQ9ESF1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OtofQ9ESF1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OtofQ9ESF1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OtofQ9ESF1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OtofQ9ESF1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OtofQ9ESF1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OtofQ9ESF1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OtofQ9ESF1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
OtofQ9ESF1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OtofQ9ESF1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OtofQ9ESF1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OtofQ9ESF1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OtofQ9ESF1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
OtofQ9ESF1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
OtofQ9ESF1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OtofQ9ESF1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OtofQ9ESF1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OtofQ9ESF1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
OtofQ9ESF1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
OtofQ9ESF1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
OtofQ9ESF1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OtofQ9ESF1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OtofQ9ESF1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OtofQ9ESF1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OtofQ9ESF1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OtofQ9ESF1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OtofQ9ESF1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OtofQ9ESF1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OtofQ9ESF1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OtofQ9ESF1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OtofQ9ESF1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OtofQ9ESF1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OtofQ9ESF1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OtofQ9ESF1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OtofQ9ESF1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OtofQ9ESF1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OtofQ9ESF1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OtofQ9ESF1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OtofQ9ESF1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OtofQ9ESF1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OtofQ9ESF1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OtofQ9ESF1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OtofQ9ESF1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OtofQ9ESF1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OtofQ9ESF1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OtofQ9ESF1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OtofQ9ESF1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OtofQ9ESF1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
OtofQ9ESF1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OtofQ9ESF1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OtofQ9ESF1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OtofQ9ESF1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OtofQ9ESF1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OtofQ9ESF1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OtofQ9ESF1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OtofQ9ESF1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OtofQ9ESF1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
OtofQ9ESF1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OtofQ9ESF1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
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