Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ush1cQ9ES64 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ush1cQ9ES64 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ush1cQ9ES64 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ush1cQ9ES64 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ush1cQ9ES64 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Ush1cQ9ES64 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ush1cQ9ES64 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Ush1cQ9ES64 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ush1cQ9ES64 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ush1cQ9ES64 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ush1cQ9ES64 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ush1cQ9ES64 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ush1cQ9ES64 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ush1cQ9ES64 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ush1cQ9ES64 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ush1cQ9ES64 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ush1cQ9ES64 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ush1cQ9ES64 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ush1cQ9ES64 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ush1cQ9ES64 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ush1cQ9ES64 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ush1cQ9ES64 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ush1cQ9ES64 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ush1cQ9ES64 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ush1cQ9ES64 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Ush1cQ9ES64 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ush1cQ9ES64 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ush1cQ9ES64 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ush1cQ9ES64 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ush1cQ9ES64 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ush1cQ9ES64 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ush1cQ9ES64 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ush1cQ9ES64 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ush1cQ9ES64 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ush1cQ9ES64 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ush1cQ9ES64 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ush1cQ9ES64 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ush1cQ9ES64 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ush1cQ9ES64 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ush1cQ9ES64 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ush1cQ9ES64 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ush1cQ9ES64 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ush1cQ9ES64 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ush1cQ9ES64 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ush1cQ9ES64 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ush1cQ9ES64 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ush1cQ9ES64 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ush1cQ9ES64 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ush1cQ9ES64 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ush1cQ9ES64 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ush1cQ9ES64 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ush1cQ9ES64 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ush1cQ9ES64 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ush1cQ9ES64 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ush1cQ9ES64 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ush1cQ9ES64 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ush1cQ9ES64 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ush1cQ9ES64 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ush1cQ9ES64 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ush1cQ9ES64 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ush1cQ9ES64 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ush1cQ9ES64 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ush1cQ9ES64 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ush1cQ9ES64 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ush1cQ9ES64 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ush1cQ9ES64 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ush1cQ9ES64 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ush1cQ9ES64 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ush1cQ9ES64 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ush1cQ9ES64 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ush1cQ9ES64 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ush1cQ9ES64 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ush1cQ9ES64 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ush1cQ9ES64 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ush1cQ9ES64 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ush1cQ9ES64 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ush1cQ9ES64 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ush1cQ9ES64 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ush1cQ9ES64 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ush1cQ9ES64 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ush1cQ9ES64 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ush1cQ9ES64 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ush1cQ9ES64 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ush1cQ9ES64 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ush1cQ9ES64 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ush1cQ9ES64 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ush1cQ9ES64 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ush1cQ9ES64 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ush1cQ9ES64 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ush1cQ9ES64 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ush1cQ9ES64 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ush1cQ9ES64 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ush1cQ9ES64 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ush1cQ9ES64 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ush1cQ9ES64 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ush1cQ9ES64 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ush1cQ9ES64 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ush1cQ9ES64 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ush1cQ9ES64 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 194 ms