Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES30

C1qtnf3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf3Q9ES30 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1qtnf3Q9ES30 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1qtnf3Q9ES30 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1qtnf3Q9ES30 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1qtnf3Q9ES30 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1qtnf3Q9ES30 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1qtnf3Q9ES30 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1qtnf3Q9ES30 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1qtnf3Q9ES30 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1qtnf3Q9ES30 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1qtnf3Q9ES30 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1qtnf3Q9ES30 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1qtnf3Q9ES30 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1qtnf3Q9ES30 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1qtnf3Q9ES30 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1qtnf3Q9ES30 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1qtnf3Q9ES30 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1qtnf3Q9ES30 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1qtnf3Q9ES30 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1qtnf3Q9ES30 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1qtnf3Q9ES30 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1qtnf3Q9ES30 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1qtnf3Q9ES30 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1qtnf3Q9ES30 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1qtnf3Q9ES30 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1qtnf3Q9ES30 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1qtnf3Q9ES30 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1qtnf3Q9ES30 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1qtnf3Q9ES30 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1qtnf3Q9ES30 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C1qtnf3Q9ES30 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C1qtnf3Q9ES30 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1qtnf3Q9ES30 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1qtnf3Q9ES30 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C1qtnf3Q9ES30 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1qtnf3Q9ES30 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1qtnf3Q9ES30 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1qtnf3Q9ES30 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1qtnf3Q9ES30 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1qtnf3Q9ES30 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1qtnf3Q9ES30 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1qtnf3Q9ES30 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1qtnf3Q9ES30 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1qtnf3Q9ES30 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1qtnf3Q9ES30 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1qtnf3Q9ES30 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1qtnf3Q9ES30 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
C1qtnf3Q9ES30 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1qtnf3Q9ES30 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1qtnf3Q9ES30 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1qtnf3Q9ES30 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1qtnf3Q9ES30 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1qtnf3Q9ES30 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1qtnf3Q9ES30 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1qtnf3Q9ES30 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1qtnf3Q9ES30 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1qtnf3Q9ES30 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1qtnf3Q9ES30 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1qtnf3Q9ES30 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1qtnf3Q9ES30 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1qtnf3Q9ES30 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1qtnf3Q9ES30 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1qtnf3Q9ES30 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C1qtnf3Q9ES30 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1qtnf3Q9ES30 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1qtnf3Q9ES30 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1qtnf3Q9ES30 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1qtnf3Q9ES30 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1qtnf3Q9ES30 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1qtnf3Q9ES30 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1qtnf3Q9ES30 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1qtnf3Q9ES30 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1qtnf3Q9ES30 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1qtnf3Q9ES30 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1qtnf3Q9ES30 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1qtnf3Q9ES30 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1qtnf3Q9ES30 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1qtnf3Q9ES30 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1qtnf3Q9ES30 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1qtnf3Q9ES30 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1qtnf3Q9ES30 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1qtnf3Q9ES30 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1qtnf3Q9ES30 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1qtnf3Q9ES30 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1qtnf3Q9ES30 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1qtnf3Q9ES30 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1qtnf3Q9ES30 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1qtnf3Q9ES30 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1qtnf3Q9ES30 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1qtnf3Q9ES30 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1qtnf3Q9ES30 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1qtnf3Q9ES30 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1qtnf3Q9ES30 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1qtnf3Q9ES30 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1qtnf3Q9ES30 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1qtnf3Q9ES30 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1qtnf3Q9ES30 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1qtnf3Q9ES30 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1qtnf3Q9ES30 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
C1qtnf3Q9ES30 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms