Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK4

Cse1l, Exportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cse1lQ9ERK4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cse1lQ9ERK4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cse1lQ9ERK4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cse1lQ9ERK4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cse1lQ9ERK4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cse1lQ9ERK4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cse1lQ9ERK4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cse1lQ9ERK4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cse1lQ9ERK4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cse1lQ9ERK4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cse1lQ9ERK4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cse1lQ9ERK4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cse1lQ9ERK4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cse1lQ9ERK4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cse1lQ9ERK4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cse1lQ9ERK4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cse1lQ9ERK4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cse1lQ9ERK4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cse1lQ9ERK4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cse1lQ9ERK4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cse1lQ9ERK4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cse1lQ9ERK4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cse1lQ9ERK4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cse1lQ9ERK4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cse1lQ9ERK4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cse1lQ9ERK4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cse1lQ9ERK4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cse1lQ9ERK4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cse1lQ9ERK4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cse1lQ9ERK4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cse1lQ9ERK4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cse1lQ9ERK4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cse1lQ9ERK4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cse1lQ9ERK4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cse1lQ9ERK4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cse1lQ9ERK4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cse1lQ9ERK4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cse1lQ9ERK4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cse1lQ9ERK4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cse1lQ9ERK4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cse1lQ9ERK4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cse1lQ9ERK4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cse1lQ9ERK4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cse1lQ9ERK4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cse1lQ9ERK4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cse1lQ9ERK4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cse1lQ9ERK4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cse1lQ9ERK4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cse1lQ9ERK4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cse1lQ9ERK4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cse1lQ9ERK4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cse1lQ9ERK4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cse1lQ9ERK4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cse1lQ9ERK4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cse1lQ9ERK4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cse1lQ9ERK4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cse1lQ9ERK4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cse1lQ9ERK4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cse1lQ9ERK4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Cse1lQ9ERK4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cse1lQ9ERK4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cse1lQ9ERK4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cse1lQ9ERK4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cse1lQ9ERK4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cse1lQ9ERK4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cse1lQ9ERK4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cse1lQ9ERK4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cse1lQ9ERK4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cse1lQ9ERK4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cse1lQ9ERK4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cse1lQ9ERK4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cse1lQ9ERK4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cse1lQ9ERK4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cse1lQ9ERK4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cse1lQ9ERK4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cse1lQ9ERK4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cse1lQ9ERK4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cse1lQ9ERK4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cse1lQ9ERK4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cse1lQ9ERK4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cse1lQ9ERK4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cse1lQ9ERK4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cse1lQ9ERK4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cse1lQ9ERK4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cse1lQ9ERK4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cse1lQ9ERK4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cse1lQ9ERK4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cse1lQ9ERK4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cse1lQ9ERK4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cse1lQ9ERK4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cse1lQ9ERK4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cse1lQ9ERK4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cse1lQ9ERK4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cse1lQ9ERK4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cse1lQ9ERK4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cse1lQ9ERK4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cse1lQ9ERK4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cse1lQ9ERK4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cse1lQ9ERK4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cse1lQ9ERK4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms