Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD8

Parvg, Gamma-parvin, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParvgQ9ERD8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ParvgQ9ERD8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ParvgQ9ERD8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ParvgQ9ERD8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ParvgQ9ERD8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ParvgQ9ERD8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ParvgQ9ERD8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ParvgQ9ERD8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ParvgQ9ERD8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ParvgQ9ERD8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ParvgQ9ERD8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ParvgQ9ERD8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ParvgQ9ERD8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ParvgQ9ERD8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ParvgQ9ERD8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ParvgQ9ERD8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ParvgQ9ERD8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ParvgQ9ERD8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ParvgQ9ERD8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ParvgQ9ERD8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ParvgQ9ERD8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ParvgQ9ERD8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ParvgQ9ERD8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ParvgQ9ERD8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ParvgQ9ERD8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ParvgQ9ERD8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ParvgQ9ERD8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ParvgQ9ERD8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ParvgQ9ERD8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ParvgQ9ERD8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ParvgQ9ERD8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ParvgQ9ERD8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ParvgQ9ERD8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ParvgQ9ERD8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ParvgQ9ERD8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
ParvgQ9ERD8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ParvgQ9ERD8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ParvgQ9ERD8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ParvgQ9ERD8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ParvgQ9ERD8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ParvgQ9ERD8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ParvgQ9ERD8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ParvgQ9ERD8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ParvgQ9ERD8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ParvgQ9ERD8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ParvgQ9ERD8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ParvgQ9ERD8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ParvgQ9ERD8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ParvgQ9ERD8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ParvgQ9ERD8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ParvgQ9ERD8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ParvgQ9ERD8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ParvgQ9ERD8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ParvgQ9ERD8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ParvgQ9ERD8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ParvgQ9ERD8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ParvgQ9ERD8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ParvgQ9ERD8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ParvgQ9ERD8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ParvgQ9ERD8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ParvgQ9ERD8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ParvgQ9ERD8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ParvgQ9ERD8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ParvgQ9ERD8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ParvgQ9ERD8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ParvgQ9ERD8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ParvgQ9ERD8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ParvgQ9ERD8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ParvgQ9ERD8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ParvgQ9ERD8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ParvgQ9ERD8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ParvgQ9ERD8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ParvgQ9ERD8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ParvgQ9ERD8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ParvgQ9ERD8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ParvgQ9ERD8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ParvgQ9ERD8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ParvgQ9ERD8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ParvgQ9ERD8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ParvgQ9ERD8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ParvgQ9ERD8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ParvgQ9ERD8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ParvgQ9ERD8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ParvgQ9ERD8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ParvgQ9ERD8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ParvgQ9ERD8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ParvgQ9ERD8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ParvgQ9ERD8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ParvgQ9ERD8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ParvgQ9ERD8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ParvgQ9ERD8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ParvgQ9ERD8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ParvgQ9ERD8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ParvgQ9ERD8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ParvgQ9ERD8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ParvgQ9ERD8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ParvgQ9ERD8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ParvgQ9ERD8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ParvgQ9ERD8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ParvgQ9ERD8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms