Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhox9Q9EQM5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhox9Q9EQM5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhox9Q9EQM5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rhox9Q9EQM5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rhox9Q9EQM5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rhox9Q9EQM5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhox9Q9EQM5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhox9Q9EQM5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhox9Q9EQM5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhox9Q9EQM5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhox9Q9EQM5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhox9Q9EQM5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rhox9Q9EQM5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rhox9Q9EQM5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhox9Q9EQM5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhox9Q9EQM5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhox9Q9EQM5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rhox9Q9EQM5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Rhox9Q9EQM5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rhox9Q9EQM5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhox9Q9EQM5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhox9Q9EQM5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhox9Q9EQM5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rhox9Q9EQM5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rhox9Q9EQM5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rhox9Q9EQM5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhox9Q9EQM5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhox9Q9EQM5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhox9Q9EQM5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhox9Q9EQM5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhox9Q9EQM5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhox9Q9EQM5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhox9Q9EQM5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhox9Q9EQM5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhox9Q9EQM5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhox9Q9EQM5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhox9Q9EQM5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhox9Q9EQM5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhox9Q9EQM5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhox9Q9EQM5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms