Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAA6

Exosc1, Exosome complex component CSL4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc1Q9DAA6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Exosc1Q9DAA6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Exosc1Q9DAA6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Exosc1Q9DAA6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Exosc1Q9DAA6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Exosc1Q9DAA6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Exosc1Q9DAA6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Exosc1Q9DAA6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Exosc1Q9DAA6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Exosc1Q9DAA6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Exosc1Q9DAA6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Exosc1Q9DAA6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Exosc1Q9DAA6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Exosc1Q9DAA6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Exosc1Q9DAA6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Exosc1Q9DAA6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Exosc1Q9DAA6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Exosc1Q9DAA6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Exosc1Q9DAA6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Exosc1Q9DAA6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Exosc1Q9DAA6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Exosc1Q9DAA6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Exosc1Q9DAA6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Exosc1Q9DAA6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Exosc1Q9DAA6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Exosc1Q9DAA6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Exosc1Q9DAA6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Exosc1Q9DAA6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Exosc1Q9DAA6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Exosc1Q9DAA6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Exosc1Q9DAA6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Exosc1Q9DAA6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Exosc1Q9DAA6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Exosc1Q9DAA6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Exosc1Q9DAA6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Exosc1Q9DAA6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Exosc1Q9DAA6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Exosc1Q9DAA6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Exosc1Q9DAA6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Exosc1Q9DAA6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Exosc1Q9DAA6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Exosc1Q9DAA6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Exosc1Q9DAA6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Exosc1Q9DAA6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Exosc1Q9DAA6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Exosc1Q9DAA6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Exosc1Q9DAA6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Exosc1Q9DAA6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Exosc1Q9DAA6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Exosc1Q9DAA6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Exosc1Q9DAA6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Exosc1Q9DAA6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Exosc1Q9DAA6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Exosc1Q9DAA6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Exosc1Q9DAA6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Exosc1Q9DAA6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Exosc1Q9DAA6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Exosc1Q9DAA6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Exosc1Q9DAA6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Exosc1Q9DAA6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Exosc1Q9DAA6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Exosc1Q9DAA6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Exosc1Q9DAA6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Exosc1Q9DAA6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Exosc1Q9DAA6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Exosc1Q9DAA6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Exosc1Q9DAA6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Exosc1Q9DAA6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Exosc1Q9DAA6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Exosc1Q9DAA6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Exosc1Q9DAA6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Exosc1Q9DAA6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Exosc1Q9DAA6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Exosc1Q9DAA6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Exosc1Q9DAA6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Exosc1Q9DAA6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Exosc1Q9DAA6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Exosc1Q9DAA6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Exosc1Q9DAA6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Exosc1Q9DAA6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Exosc1Q9DAA6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Exosc1Q9DAA6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Exosc1Q9DAA6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Exosc1Q9DAA6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Exosc1Q9DAA6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Exosc1Q9DAA6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Exosc1Q9DAA6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Exosc1Q9DAA6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Exosc1Q9DAA6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Exosc1Q9DAA6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Exosc1Q9DAA6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Exosc1Q9DAA6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Exosc1Q9DAA6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Exosc1Q9DAA6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Exosc1Q9DAA6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Exosc1Q9DAA6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Exosc1Q9DAA6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Exosc1Q9DAA6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Exosc1Q9DAA6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Exosc1Q9DAA6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms