Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA83

1700018B08Rik, RIKEN cDNA 1700018B08, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018B08RikQ9DA83 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
1700018B08RikQ9DA83 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
1700018B08RikQ9DA83 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
1700018B08RikQ9DA83 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
1700018B08RikQ9DA83 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
1700018B08RikQ9DA83 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
1700018B08RikQ9DA83 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
1700018B08RikQ9DA83 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
1700018B08RikQ9DA83 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
1700018B08RikQ9DA83 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
1700018B08RikQ9DA83 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
1700018B08RikQ9DA83 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
1700018B08RikQ9DA83 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
1700018B08RikQ9DA83 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
1700018B08RikQ9DA83 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
1700018B08RikQ9DA83 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
1700018B08RikQ9DA83 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
1700018B08RikQ9DA83 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
1700018B08RikQ9DA83 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
1700018B08RikQ9DA83 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
1700018B08RikQ9DA83 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
1700018B08RikQ9DA83 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
1700018B08RikQ9DA83 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
1700018B08RikQ9DA83 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
1700018B08RikQ9DA83 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
1700018B08RikQ9DA83 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
1700018B08RikQ9DA83 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
1700018B08RikQ9DA83 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
1700018B08RikQ9DA83 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
1700018B08RikQ9DA83 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
1700018B08RikQ9DA83 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
1700018B08RikQ9DA83 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
1700018B08RikQ9DA83 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
1700018B08RikQ9DA83 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
1700018B08RikQ9DA83 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
1700018B08RikQ9DA83 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
1700018B08RikQ9DA83 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
1700018B08RikQ9DA83 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
1700018B08RikQ9DA83 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
1700018B08RikQ9DA83 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
1700018B08RikQ9DA83 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
1700018B08RikQ9DA83 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
1700018B08RikQ9DA83 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28■■■□□ 2.07
1700018B08RikQ9DA83 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
1700018B08RikQ9DA83 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
1700018B08RikQ9DA83 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
1700018B08RikQ9DA83 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
1700018B08RikQ9DA83 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
1700018B08RikQ9DA83 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
1700018B08RikQ9DA83 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
1700018B08RikQ9DA83 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
1700018B08RikQ9DA83 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
1700018B08RikQ9DA83 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
1700018B08RikQ9DA83 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
1700018B08RikQ9DA83 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
1700018B08RikQ9DA83 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
1700018B08RikQ9DA83 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
1700018B08RikQ9DA83 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
1700018B08RikQ9DA83 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
1700018B08RikQ9DA83 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
1700018B08RikQ9DA83 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
1700018B08RikQ9DA83 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
1700018B08RikQ9DA83 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
1700018B08RikQ9DA83 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
1700018B08RikQ9DA83 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
1700018B08RikQ9DA83 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
1700018B08RikQ9DA83 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
1700018B08RikQ9DA83 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
1700018B08RikQ9DA83 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
1700018B08RikQ9DA83 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
1700018B08RikQ9DA83 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
1700018B08RikQ9DA83 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
1700018B08RikQ9DA83 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
1700018B08RikQ9DA83 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
1700018B08RikQ9DA83 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
1700018B08RikQ9DA83 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
1700018B08RikQ9DA83 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
1700018B08RikQ9DA83 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
1700018B08RikQ9DA83 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
1700018B08RikQ9DA83 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
1700018B08RikQ9DA83 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
1700018B08RikQ9DA83 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
1700018B08RikQ9DA83 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
1700018B08RikQ9DA83 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
1700018B08RikQ9DA83 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
1700018B08RikQ9DA83 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
1700018B08RikQ9DA83 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
1700018B08RikQ9DA83 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
1700018B08RikQ9DA83 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
1700018B08RikQ9DA83 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
1700018B08RikQ9DA83 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
1700018B08RikQ9DA83 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
1700018B08RikQ9DA83 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
1700018B08RikQ9DA83 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
1700018B08RikQ9DA83 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
1700018B08RikQ9DA83 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
1700018B08RikQ9DA83 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
1700018B08RikQ9DA83 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
1700018B08RikQ9DA83 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
1700018B08RikQ9DA83 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms