Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sgf29Q9DA08 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sgf29Q9DA08 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sgf29Q9DA08 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sgf29Q9DA08 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Sgf29Q9DA08 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sgf29Q9DA08 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sgf29Q9DA08 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sgf29Q9DA08 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sgf29Q9DA08 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sgf29Q9DA08 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sgf29Q9DA08 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sgf29Q9DA08 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sgf29Q9DA08 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sgf29Q9DA08 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sgf29Q9DA08 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sgf29Q9DA08 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sgf29Q9DA08 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sgf29Q9DA08 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sgf29Q9DA08 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sgf29Q9DA08 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sgf29Q9DA08 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sgf29Q9DA08 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sgf29Q9DA08 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sgf29Q9DA08 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Sgf29Q9DA08 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sgf29Q9DA08 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sgf29Q9DA08 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sgf29Q9DA08 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sgf29Q9DA08 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sgf29Q9DA08 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sgf29Q9DA08 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sgf29Q9DA08 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sgf29Q9DA08 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sgf29Q9DA08 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sgf29Q9DA08 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sgf29Q9DA08 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sgf29Q9DA08 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sgf29Q9DA08 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sgf29Q9DA08 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sgf29Q9DA08 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sgf29Q9DA08 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sgf29Q9DA08 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sgf29Q9DA08 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sgf29Q9DA08 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sgf29Q9DA08 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sgf29Q9DA08 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sgf29Q9DA08 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sgf29Q9DA08 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sgf29Q9DA08 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sgf29Q9DA08 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sgf29Q9DA08 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Sgf29Q9DA08 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sgf29Q9DA08 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sgf29Q9DA08 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sgf29Q9DA08 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sgf29Q9DA08 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sgf29Q9DA08 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sgf29Q9DA08 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sgf29Q9DA08 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sgf29Q9DA08 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sgf29Q9DA08 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sgf29Q9DA08 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sgf29Q9DA08 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sgf29Q9DA08 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Sgf29Q9DA08 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sgf29Q9DA08 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sgf29Q9DA08 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Sgf29Q9DA08 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sgf29Q9DA08 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Sgf29Q9DA08 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sgf29Q9DA08 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sgf29Q9DA08 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sgf29Q9DA08 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sgf29Q9DA08 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sgf29Q9DA08 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sgf29Q9DA08 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sgf29Q9DA08 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sgf29Q9DA08 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sgf29Q9DA08 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sgf29Q9DA08 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sgf29Q9DA08 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sgf29Q9DA08 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sgf29Q9DA08 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sgf29Q9DA08 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sgf29Q9DA08 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sgf29Q9DA08 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sgf29Q9DA08 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sgf29Q9DA08 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sgf29Q9DA08 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sgf29Q9DA08 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sgf29Q9DA08 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sgf29Q9DA08 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sgf29Q9DA08 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sgf29Q9DA08 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sgf29Q9DA08 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sgf29Q9DA08 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sgf29Q9DA08 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sgf29Q9DA08 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sgf29Q9DA08 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms