Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9P8

Llcfc1, LLLL and CFNLAS motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Llcfc1Q9D9P8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Llcfc1Q9D9P8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Llcfc1Q9D9P8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Llcfc1Q9D9P8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Llcfc1Q9D9P8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Llcfc1Q9D9P8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Llcfc1Q9D9P8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Llcfc1Q9D9P8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Llcfc1Q9D9P8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Llcfc1Q9D9P8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Llcfc1Q9D9P8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Llcfc1Q9D9P8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Llcfc1Q9D9P8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Llcfc1Q9D9P8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Llcfc1Q9D9P8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Llcfc1Q9D9P8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Llcfc1Q9D9P8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Llcfc1Q9D9P8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Llcfc1Q9D9P8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Llcfc1Q9D9P8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Llcfc1Q9D9P8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Llcfc1Q9D9P8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Llcfc1Q9D9P8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Llcfc1Q9D9P8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Llcfc1Q9D9P8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Llcfc1Q9D9P8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Llcfc1Q9D9P8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Llcfc1Q9D9P8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Llcfc1Q9D9P8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Llcfc1Q9D9P8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Llcfc1Q9D9P8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Llcfc1Q9D9P8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Llcfc1Q9D9P8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Llcfc1Q9D9P8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Llcfc1Q9D9P8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Llcfc1Q9D9P8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Llcfc1Q9D9P8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Llcfc1Q9D9P8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Llcfc1Q9D9P8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Llcfc1Q9D9P8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Llcfc1Q9D9P8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Llcfc1Q9D9P8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Llcfc1Q9D9P8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Llcfc1Q9D9P8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Llcfc1Q9D9P8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Llcfc1Q9D9P8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Llcfc1Q9D9P8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Llcfc1Q9D9P8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Llcfc1Q9D9P8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Llcfc1Q9D9P8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Llcfc1Q9D9P8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Llcfc1Q9D9P8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Llcfc1Q9D9P8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Llcfc1Q9D9P8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Llcfc1Q9D9P8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Llcfc1Q9D9P8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Llcfc1Q9D9P8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Llcfc1Q9D9P8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Llcfc1Q9D9P8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Llcfc1Q9D9P8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Llcfc1Q9D9P8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Llcfc1Q9D9P8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Llcfc1Q9D9P8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Llcfc1Q9D9P8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Llcfc1Q9D9P8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Llcfc1Q9D9P8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Llcfc1Q9D9P8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Llcfc1Q9D9P8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Llcfc1Q9D9P8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Llcfc1Q9D9P8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Llcfc1Q9D9P8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Llcfc1Q9D9P8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Llcfc1Q9D9P8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Llcfc1Q9D9P8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Llcfc1Q9D9P8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Llcfc1Q9D9P8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Llcfc1Q9D9P8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Llcfc1Q9D9P8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Llcfc1Q9D9P8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Llcfc1Q9D9P8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Llcfc1Q9D9P8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Llcfc1Q9D9P8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Llcfc1Q9D9P8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Llcfc1Q9D9P8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Llcfc1Q9D9P8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Llcfc1Q9D9P8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Llcfc1Q9D9P8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Llcfc1Q9D9P8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Llcfc1Q9D9P8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Llcfc1Q9D9P8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Llcfc1Q9D9P8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Llcfc1Q9D9P8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Llcfc1Q9D9P8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Llcfc1Q9D9P8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Llcfc1Q9D9P8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Llcfc1Q9D9P8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Llcfc1Q9D9P8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Llcfc1Q9D9P8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Llcfc1Q9D9P8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Llcfc1Q9D9P8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms