Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J8

Bpifa3, BPI fold-containing family A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bpifa3Q9D9J8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bpifa3Q9D9J8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bpifa3Q9D9J8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Bpifa3Q9D9J8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bpifa3Q9D9J8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bpifa3Q9D9J8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bpifa3Q9D9J8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bpifa3Q9D9J8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bpifa3Q9D9J8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bpifa3Q9D9J8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bpifa3Q9D9J8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bpifa3Q9D9J8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bpifa3Q9D9J8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bpifa3Q9D9J8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bpifa3Q9D9J8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bpifa3Q9D9J8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bpifa3Q9D9J8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bpifa3Q9D9J8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bpifa3Q9D9J8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Bpifa3Q9D9J8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bpifa3Q9D9J8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bpifa3Q9D9J8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bpifa3Q9D9J8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bpifa3Q9D9J8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bpifa3Q9D9J8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Bpifa3Q9D9J8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bpifa3Q9D9J8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bpifa3Q9D9J8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bpifa3Q9D9J8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bpifa3Q9D9J8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bpifa3Q9D9J8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bpifa3Q9D9J8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bpifa3Q9D9J8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bpifa3Q9D9J8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bpifa3Q9D9J8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bpifa3Q9D9J8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bpifa3Q9D9J8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bpifa3Q9D9J8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bpifa3Q9D9J8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bpifa3Q9D9J8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bpifa3Q9D9J8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bpifa3Q9D9J8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bpifa3Q9D9J8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bpifa3Q9D9J8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bpifa3Q9D9J8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Bpifa3Q9D9J8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bpifa3Q9D9J8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bpifa3Q9D9J8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bpifa3Q9D9J8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bpifa3Q9D9J8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bpifa3Q9D9J8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bpifa3Q9D9J8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bpifa3Q9D9J8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bpifa3Q9D9J8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bpifa3Q9D9J8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bpifa3Q9D9J8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bpifa3Q9D9J8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bpifa3Q9D9J8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Bpifa3Q9D9J8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bpifa3Q9D9J8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bpifa3Q9D9J8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bpifa3Q9D9J8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bpifa3Q9D9J8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bpifa3Q9D9J8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bpifa3Q9D9J8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bpifa3Q9D9J8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Bpifa3Q9D9J8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Bpifa3Q9D9J8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bpifa3Q9D9J8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bpifa3Q9D9J8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bpifa3Q9D9J8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bpifa3Q9D9J8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bpifa3Q9D9J8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bpifa3Q9D9J8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bpifa3Q9D9J8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bpifa3Q9D9J8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bpifa3Q9D9J8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bpifa3Q9D9J8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bpifa3Q9D9J8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bpifa3Q9D9J8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bpifa3Q9D9J8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bpifa3Q9D9J8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bpifa3Q9D9J8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bpifa3Q9D9J8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bpifa3Q9D9J8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bpifa3Q9D9J8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bpifa3Q9D9J8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bpifa3Q9D9J8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bpifa3Q9D9J8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bpifa3Q9D9J8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bpifa3Q9D9J8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bpifa3Q9D9J8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bpifa3Q9D9J8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bpifa3Q9D9J8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bpifa3Q9D9J8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bpifa3Q9D9J8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bpifa3Q9D9J8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bpifa3Q9D9J8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bpifa3Q9D9J8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bpifa3Q9D9J8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms