Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmco5aQ9D9D5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmco5aQ9D9D5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmco5aQ9D9D5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tmco5aQ9D9D5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tmco5aQ9D9D5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmco5aQ9D9D5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmco5aQ9D9D5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmco5aQ9D9D5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmco5aQ9D9D5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmco5aQ9D9D5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmco5aQ9D9D5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmco5aQ9D9D5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmco5aQ9D9D5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmco5aQ9D9D5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmco5aQ9D9D5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmco5aQ9D9D5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmco5aQ9D9D5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmco5aQ9D9D5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmco5aQ9D9D5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmco5aQ9D9D5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmco5aQ9D9D5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmco5aQ9D9D5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmco5aQ9D9D5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmco5aQ9D9D5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmco5aQ9D9D5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmco5aQ9D9D5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmco5aQ9D9D5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmco5aQ9D9D5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmco5aQ9D9D5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmco5aQ9D9D5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmco5aQ9D9D5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmco5aQ9D9D5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmco5aQ9D9D5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmco5aQ9D9D5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmco5aQ9D9D5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmco5aQ9D9D5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmco5aQ9D9D5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmco5aQ9D9D5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmco5aQ9D9D5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmco5aQ9D9D5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmco5aQ9D9D5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmco5aQ9D9D5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmco5aQ9D9D5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmco5aQ9D9D5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmco5aQ9D9D5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmco5aQ9D9D5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmco5aQ9D9D5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmco5aQ9D9D5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmco5aQ9D9D5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmco5aQ9D9D5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmco5aQ9D9D5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmco5aQ9D9D5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tmco5aQ9D9D5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tmco5aQ9D9D5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmco5aQ9D9D5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmco5aQ9D9D5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmco5aQ9D9D5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmco5aQ9D9D5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmco5aQ9D9D5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmco5aQ9D9D5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmco5aQ9D9D5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmco5aQ9D9D5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmco5aQ9D9D5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmco5aQ9D9D5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmco5aQ9D9D5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmco5aQ9D9D5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmco5aQ9D9D5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmco5aQ9D9D5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmco5aQ9D9D5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmco5aQ9D9D5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmco5aQ9D9D5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmco5aQ9D9D5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmco5aQ9D9D5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmco5aQ9D9D5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmco5aQ9D9D5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmco5aQ9D9D5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmco5aQ9D9D5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmco5aQ9D9D5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmco5aQ9D9D5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmco5aQ9D9D5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmco5aQ9D9D5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmco5aQ9D9D5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmco5aQ9D9D5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmco5aQ9D9D5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmco5aQ9D9D5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmco5aQ9D9D5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmco5aQ9D9D5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmco5aQ9D9D5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmco5aQ9D9D5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmco5aQ9D9D5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmco5aQ9D9D5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmco5aQ9D9D5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmco5aQ9D9D5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmco5aQ9D9D5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmco5aQ9D9D5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmco5aQ9D9D5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmco5aQ9D9D5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmco5aQ9D9D5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmco5aQ9D9D5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.2 ms