Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9C0

1700109H08Rik, RIKEN cDNA 1700109H08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700109H08RikQ9D9C0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
1700109H08RikQ9D9C0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
1700109H08RikQ9D9C0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
1700109H08RikQ9D9C0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
1700109H08RikQ9D9C0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
1700109H08RikQ9D9C0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
1700109H08RikQ9D9C0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
1700109H08RikQ9D9C0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
1700109H08RikQ9D9C0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
1700109H08RikQ9D9C0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
1700109H08RikQ9D9C0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
1700109H08RikQ9D9C0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
1700109H08RikQ9D9C0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700109H08RikQ9D9C0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700109H08RikQ9D9C0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700109H08RikQ9D9C0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700109H08RikQ9D9C0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700109H08RikQ9D9C0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700109H08RikQ9D9C0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700109H08RikQ9D9C0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700109H08RikQ9D9C0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700109H08RikQ9D9C0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700109H08RikQ9D9C0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700109H08RikQ9D9C0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700109H08RikQ9D9C0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700109H08RikQ9D9C0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700109H08RikQ9D9C0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700109H08RikQ9D9C0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
1700109H08RikQ9D9C0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700109H08RikQ9D9C0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700109H08RikQ9D9C0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
1700109H08RikQ9D9C0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
1700109H08RikQ9D9C0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
1700109H08RikQ9D9C0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700109H08RikQ9D9C0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700109H08RikQ9D9C0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700109H08RikQ9D9C0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
1700109H08RikQ9D9C0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
1700109H08RikQ9D9C0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
1700109H08RikQ9D9C0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
1700109H08RikQ9D9C0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700109H08RikQ9D9C0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700109H08RikQ9D9C0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700109H08RikQ9D9C0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700109H08RikQ9D9C0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700109H08RikQ9D9C0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
1700109H08RikQ9D9C0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
1700109H08RikQ9D9C0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
1700109H08RikQ9D9C0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
1700109H08RikQ9D9C0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
1700109H08RikQ9D9C0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
1700109H08RikQ9D9C0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700109H08RikQ9D9C0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700109H08RikQ9D9C0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700109H08RikQ9D9C0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700109H08RikQ9D9C0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700109H08RikQ9D9C0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700109H08RikQ9D9C0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700109H08RikQ9D9C0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700109H08RikQ9D9C0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
1700109H08RikQ9D9C0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
1700109H08RikQ9D9C0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
1700109H08RikQ9D9C0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
1700109H08RikQ9D9C0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
1700109H08RikQ9D9C0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
1700109H08RikQ9D9C0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
1700109H08RikQ9D9C0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700109H08RikQ9D9C0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700109H08RikQ9D9C0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1700109H08RikQ9D9C0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700109H08RikQ9D9C0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700109H08RikQ9D9C0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700109H08RikQ9D9C0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
1700109H08RikQ9D9C0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700109H08RikQ9D9C0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700109H08RikQ9D9C0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700109H08RikQ9D9C0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700109H08RikQ9D9C0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700109H08RikQ9D9C0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
1700109H08RikQ9D9C0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
1700109H08RikQ9D9C0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
1700109H08RikQ9D9C0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
1700109H08RikQ9D9C0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
1700109H08RikQ9D9C0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
1700109H08RikQ9D9C0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700109H08RikQ9D9C0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700109H08RikQ9D9C0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700109H08RikQ9D9C0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700109H08RikQ9D9C0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700109H08RikQ9D9C0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
1700109H08RikQ9D9C0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700109H08RikQ9D9C0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
1700109H08RikQ9D9C0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700109H08RikQ9D9C0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
1700109H08RikQ9D9C0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700109H08RikQ9D9C0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700109H08RikQ9D9C0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700109H08RikQ9D9C0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700109H08RikQ9D9C0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1700109H08RikQ9D9C0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms