Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X2

Ccdc124, Coiled-coil domain-containing protein 124, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc124Q9D8X2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc124Q9D8X2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc124Q9D8X2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc124Q9D8X2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc124Q9D8X2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc124Q9D8X2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc124Q9D8X2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc124Q9D8X2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc124Q9D8X2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc124Q9D8X2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc124Q9D8X2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc124Q9D8X2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc124Q9D8X2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc124Q9D8X2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc124Q9D8X2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc124Q9D8X2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc124Q9D8X2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc124Q9D8X2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc124Q9D8X2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc124Q9D8X2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc124Q9D8X2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc124Q9D8X2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc124Q9D8X2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc124Q9D8X2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc124Q9D8X2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc124Q9D8X2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc124Q9D8X2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc124Q9D8X2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc124Q9D8X2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc124Q9D8X2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc124Q9D8X2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc124Q9D8X2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc124Q9D8X2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc124Q9D8X2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc124Q9D8X2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc124Q9D8X2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc124Q9D8X2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc124Q9D8X2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc124Q9D8X2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc124Q9D8X2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc124Q9D8X2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc124Q9D8X2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc124Q9D8X2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc124Q9D8X2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc124Q9D8X2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc124Q9D8X2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc124Q9D8X2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc124Q9D8X2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc124Q9D8X2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc124Q9D8X2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc124Q9D8X2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc124Q9D8X2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc124Q9D8X2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc124Q9D8X2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc124Q9D8X2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc124Q9D8X2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc124Q9D8X2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc124Q9D8X2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc124Q9D8X2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc124Q9D8X2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc124Q9D8X2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc124Q9D8X2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc124Q9D8X2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc124Q9D8X2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc124Q9D8X2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc124Q9D8X2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc124Q9D8X2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc124Q9D8X2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc124Q9D8X2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc124Q9D8X2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc124Q9D8X2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc124Q9D8X2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc124Q9D8X2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc124Q9D8X2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc124Q9D8X2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc124Q9D8X2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc124Q9D8X2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc124Q9D8X2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc124Q9D8X2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc124Q9D8X2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc124Q9D8X2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc124Q9D8X2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc124Q9D8X2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc124Q9D8X2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc124Q9D8X2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc124Q9D8X2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc124Q9D8X2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc124Q9D8X2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc124Q9D8X2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc124Q9D8X2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc124Q9D8X2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc124Q9D8X2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc124Q9D8X2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc124Q9D8X2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc124Q9D8X2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc124Q9D8X2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc124Q9D8X2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc124Q9D8X2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc124Q9D8X2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc124Q9D8X2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms